Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Prrt1O35449 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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