Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rnft1Q9DCN7 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.8 ms