Protein–RNA interactions for Protein: Q12500

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9, yeastyeast

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVL9Q12500 SWI4YER111C 3282 nt1.37□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 PIP2YOR363C 2991 nt1.37□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YER097WYER097W 330 nt1.36□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 RPL34BYIL052C 366 nt1.36□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 IFH1YLR223C 3258 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 CUL3YGR003W 2235 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 HTL1YCR020W-B 237 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YPR063CYPR063C 423 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 PKH2YOL100W 3246 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 AIM44YPL158C 2277 nt1.35□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.34□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YFL063WYFL063W 456 nt1.34□□□□□ -2.19
AVL9Q12500 YCK3YER123W 1575 nt1.34□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 MMS4YBR098W 2076 nt1.33□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 DBP6YNR038W 1890 nt1.33□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 APL3YBL037W 3078 nt1.33□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 CDC25YLR310C 4770 nt1.33□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 SLD3YGL113W 2007 nt1.33□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 SEC3YER008C 4011 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YLL007CYLL007C 1998 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 PBY1YBR094W 2262 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 GPG1YGL121C 381 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 ANS1YHR126C 480 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YLL020CYLL020C 306 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 RAD9YDR217C 3930 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 SET3YKR029C 2256 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 FIG4YNL325C 2640 nt1.32□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YDL206WYDL206W 2289 nt1.31□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 SSS1YDR086C 243 nt1.31□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 RPL39YJL189W 156 nt1.31□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 RRT15YLR162W-A 189 nt1.31□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 PTP2YOR208W 2253 nt1.31□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 AHC1YOR023C 1701 nt1.3□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YDR521WYDR521W 336 nt1.3□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.3□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 STE5YDR103W 2754 nt1.3□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 SPO75YLL005C 2607 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YGL149WYGL149W 306 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 NUP145YGL092W 3954 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 STO1YMR125W 2586 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 NST1YNL091W 3723 nt1.29□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 PAN2YGL094C 3348 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 YDR344CYDR344C 444 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.28□□□□□ -2.2
AVL9Q12500 PDE2YOR360C 1581 nt1.27□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 HMRA2YCR096C 360 nt1.27□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YIL032CYIL032C 357 nt1.27□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YBR206WYBR206W 324 nt1.27□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 EAF1YDR359C 2949 nt1.26□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 CDC36YDL165W 576 nt1.26□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YAR009CYAR009C 3591 nt1.26□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 CDC39YCR093W 6327 nt1.26□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 STB6YKL072W 2301 nt1.26□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 snR60snR60 104 nt1.25□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YJL120WYJL120W 324 nt1.25□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 RPS25BYLR333C 327 nt1.25□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 INA22YIR024C 651 nt1.24□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YNL146WYNL146W 303 nt1.24□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 RPL33BYOR234C 324 nt1.24□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 ROM2YLR371W 4071 nt1.23□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.23□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 SPO21YOL091W 1830 nt1.23□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YPR117WYPR117W 7470 nt1.23□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YHL042WYHL042W 453 nt1.22□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.22□□□□□ -2.21
AVL9Q12500 IML1YJR138W 4755 nt1.21□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 ALG13YGL047W 609 nt1.21□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 YMR321CYMR321C 318 nt1.21□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 VIK1YPL253C 1944 nt1.21□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 WAR1YML076C 2835 nt1.2□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 COG8YML071C 1824 nt1.19□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 NUP157YER105C 4176 nt1.19□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 YBR064WYBR064W 429 nt1.19□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 MYO1YHR023W 5787 nt1.19□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.18□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 RPS27BYHR021C 249 nt1.17□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 YJR029WYJR029W 5268 nt1.16□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.16□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 SIP4YJL089W 2490 nt1.16□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 YGR130CYGR130C 2451 nt1.15□□□□□ -2.22
AVL9Q12500 TTI1YKL033W 3117 nt1.15□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 snR65snR65 100 nt1.15□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 CSE2YNR010W 450 nt1.15□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 YOR218CYOR218C 420 nt1.15□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 ECM12YHR021W-A 456 nt1.14□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 APL1YJR005W 2103 nt1.13□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 RAD61YDR014W 1944 nt1.13□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 YNL028WYNL028W 318 nt1.13□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.13□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 SPT7YBR081C 3999 nt1.13□□□□□ -2.23
AVL9Q12500 OLI1Q0130 231 nt1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 57.9 ms