Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YKU70YMR284W 1809 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 OST4YDL232W 111 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 HTB1YDR224C 396 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 snR128snR128 126 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YOR366WYOR366W 354 nt-0.44□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 ACF4YJR083C 930 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YNR077CYNR077C 255 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 LOC1YFR001W 615 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YGL204CYGL204C 306 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.45□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.46□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 UBS1YBR165W 834 nt-0.46□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YEL073CYEL073C 324 nt-0.47□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 IRC13YOR235W 315 nt-0.47□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 SRB7YDR308C 423 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 NFU1YKL040C 771 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 ATG16YMR159C 453 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 PBI2YNL015W 228 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YNL146WYNL146W 303 nt-0.47□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 RRI2YOL117W 1938 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YKL111CYKL111C 336 nt-0.48□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YAP6YDR259C 1152 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 MCM10YIL150C 1716 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YBR206WYBR206W 324 nt-0.49□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 DCP1YOL149W 696 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 PAA1YDR071C 576 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 EMC4YGL231C 573 nt-0.5□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YDR269CYDR269C 324 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.51□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 CWC23YGL128C 852 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 VAM3YOR106W 852 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YOR364WYOR364W 369 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.52□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 POL32YJR043C 1053 nt-0.53□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt-0.53□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 IRC16YPR038W 360 nt-0.53□□□□□ -2.49
TY1B-BLQ12490 COY1YKL179C 2040 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.54□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 SNU56YDR240C 1479 nt-0.55□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 SEM1YDR363W-A 270 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 ILM1YJR118C 612 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YPL261CYPL261C 309 nt-0.57□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YPR096CYPR096C 303 nt-0.58□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YKL202WYKL202W 582 nt-0.59□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YLR171WYLR171W 390 nt-0.59□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YLR198CYLR198C 360 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.6□□□□□ -2.5
TY1B-BLQ12490 SPO21YOL091W 1830 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 BUD26YDR241W 288 nt-0.6□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YDR220CYDR220C 294 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YIR044CYIR044C 186 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt-0.61□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 snR33snR33 183 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 DIE2YGR227W 1578 nt-0.62□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YGL239CYGL239C 315 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YJL120WYJL120W 324 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YOR345CYOR345C 351 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YPL205CYPL205C 345 nt-0.63□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 ECL1YGR146C 636 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YML108WYML108W 318 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 snR51snR51 107 nt-0.64□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 RPS20YHL015W 366 nt-0.65□□□□□ -2.51
TY1B-BLQ12490 TIM13YGR181W 318 nt-0.66□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 PTP2YOR208W 2253 nt-0.66□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt-0.67□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 IPP1YBR011C 864 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 HUR1YGL168W 333 nt-0.68□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 ATG31YDR022C 591 nt-0.69□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YGL015CYGL015C 393 nt-0.69□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-0.69□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 MRPL32YCR003W 552 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YCR022CYCR022C 345 nt-0.7□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 snR5snR5 204 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YGR228WYGR228W 345 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 CUP1-1YHR053C 186 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 CUP1-2YHR055C 186 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YNL319WYNL319W 441 nt-0.71□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 snR72snR72 98 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YGR115CYGR115C 780 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YLR217WYLR217W 324 nt-0.72□□□□□ -2.52
TY1B-BLQ12490 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.73□□□□□ -2.53
TY1B-BLQ12490 BER1YLR412W 825 nt-0.73□□□□□ -2.53
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