Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 LAA1YJL207C 6045 nt1.03□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 SPO75YLL005C 2607 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 PCC1YKR095W-A 267 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 RIM20YOR275C 1986 nt1.02□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YAF9YNL107W 681 nt1.01□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 APL1YJR005W 2103 nt1.01□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 STB6YKL072W 2301 nt1□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 SLI15YBR156C 2097 nt1□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 CDC39YCR093W 6327 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 COG4YPR105C 2586 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YAR029WYAR029W 225 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 HTB2YBL002W 396 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 LCD1YDR499W 2244 nt0.99□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 RAD34YDR314C 2079 nt0.98□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 MAM33YIL070C 801 nt0.98□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YDR048CYDR048C 315 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 FIG4YNL325C 2640 nt0.97□□□□□ -2.25
PRP46Q12417 SLD3YGL113W 2007 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 HUG1YML058W-A 207 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YPL225WYPL225W 441 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 ALY2YJL084C 3141 nt0.96□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 ROM2YLR371W 4071 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 PKH2YOL100W 3246 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 NIP100YPL174C 2607 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 VAM6YDL077C 3150 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YDR102CYDR102C 333 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 RPL34BYIL052C 366 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YJR011CYJR011C 786 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 SET3YKR029C 2256 nt0.95□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 MMS4YBR098W 2076 nt0.94□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 STF2YGR008C 255 nt0.94□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 SPT7YBR081C 3999 nt0.94□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 STO1YMR125W 2586 nt0.93□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt0.93□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 TAR1YLR154W-C 375 nt0.93□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YDL206WYDL206W 2289 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 PDE2YOR360C 1581 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 KAP120YPL125W 3099 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 GPG1YGL121C 381 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 snR36snR36 182 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 CUL3YGR003W 2235 nt0.92□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 NUP157YER105C 4176 nt0.91□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YCK3YER123W 1575 nt0.91□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 YLL007CYLL007C 1998 nt0.9□□□□□ -2.26
PRP46Q12417 NHP2YDL208W 471 nt0.9□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 SSS1YDR086C 243 nt0.9□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YIR044CYIR044C 186 nt0.9□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 IFH1YLR223C 3258 nt0.9□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 OST1YJL002C 1431 nt0.89□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 DBP6YNR038W 1890 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 GEA2YEL022W 4380 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YFL032WYFL032W 321 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 PAM16YJL104W 450 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YAR009CYAR009C 3591 nt0.88□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YDR413CYDR413C 576 nt0.87□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YBR206WYBR206W 324 nt0.87□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 PTP2YOR208W 2253 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YDR521WYDR521W 336 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YKL118WYKL118W 312 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YKL136WYKL136W 399 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 WAR1YML076C 2835 nt0.86□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 SCC2YDR180W 4482 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 ECM12YHR021W-A 456 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.85□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 DOP1YDR141C 5097 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 snR60snR60 104 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 YER097WYER097W 330 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 Q0142Q0142 177 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 RPS25BYLR333C 327 nt0.84□□□□□ -2.27
PRP46Q12417 BEM2YER155C 6504 nt0.84□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 HTL1YCR020W-B 237 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 HMRA2YCR096C 360 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YIL032CYIL032C 357 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 INA22YIR024C 651 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YBR064WYBR064W 429 nt0.83□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 PAN2YGL094C 3348 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 SPO21YOL091W 1830 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 SMC1YFL008W 3678 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YDR344CYDR344C 444 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YFL063WYFL063W 456 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YGL149WYGL149W 306 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.82□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 YJL120WYJL120W 324 nt0.81□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 BUD3YCL014W 4911 nt0.81□□□□□ -2.28
PRP46Q12417 RPS30BYOR182C 192 nt0.8□□□□□ -2.28
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