Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 EAF1YDR359C 2949 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 CLU1YMR012W 3834 nt0.99□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YDL206WYDL206W 2289 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YAR053WYAR053W 297 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 TTI1YKL033W 3117 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 IML1YJR138W 4755 nt0.98□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YJR029WYJR029W 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 STB6YKL072W 2301 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 MAM33YIL070C 801 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 SLD3YGL113W 2007 nt0.97□□□□□ -2.25
RPN6Q12377 IFH1YLR223C 3258 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 YGR035CYGR035C 351 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 BIL1YOR304C-A 231 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 WAR1YML076C 2835 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 SCC2YDR180W 4482 nt0.95□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 SMC1YFL008W 3678 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 PTP2YOR208W 2253 nt0.94□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 BEM2YER155C 6504 nt0.93□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 ROM2YLR371W 4071 nt0.93□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 YAR009CYAR009C 3591 nt0.93□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 YLL007CYLL007C 1998 nt0.93□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 PAN2YGL094C 3348 nt0.92□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 CSN9YDR179C 489 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 CDC39YCR093W 6327 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 NIP100YPL174C 2607 nt0.91□□□□□ -2.26
RPN6Q12377 NUP157YER105C 4176 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.9□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YJR011CYJR011C 786 nt0.89□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 GEA2YEL022W 4380 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YAR029WYAR029W 225 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 HTB2YBL002W 396 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 DOP1YDR141C 5097 nt0.88□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YOR029WYOR029W 336 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YPR012WYPR012W 255 nt0.87□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 HMRA2YCR096C 360 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 RPL35AYDL191W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YDR521WYDR521W 336 nt0.85□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 OST1YJL002C 1431 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YHL042WYHL042W 453 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YLR334CYLR334C 381 nt0.84□□□□□ -2.27
RPN6Q12377 YCK3YER123W 1575 nt0.83□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 KAP120YPL125W 3099 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YDL196WYDL196W 330 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 IES4YOR189W 351 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.82□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 ISD11YER048W-A 285 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 ALG13YGL047W 609 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YBR206WYBR206W 324 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 DBP6YNR038W 1890 nt0.81□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YDR048CYDR048C 315 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YBR064WYBR064W 429 nt0.8□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 OLI1Q0130 231 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 ECM12YHR021W-A 456 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YOR282WYOR282W 321 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YPR197CYPR197C 564 nt0.79□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 TAR1YLR154W-C 375 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YPL044CYPL044C 549 nt0.78□□□□□ -2.28
RPN6Q12377 YDR344CYDR344C 444 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 SPO21YOL091W 1830 nt0.77□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 RPS25BYLR333C 327 nt0.76□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 PAA1YDR071C 576 nt0.74□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 CMC4YMR194C-B 222 nt0.74□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 YAF9YNL107W 681 nt0.74□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 MCM10YIL150C 1716 nt0.74□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 SEC1YDR164C 2175 nt0.74□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 NOP9YJL010C 2001 nt0.73□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 SSS1YDR086C 243 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 YJL120WYJL120W 324 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 YMR321CYMR321C 318 nt0.72□□□□□ -2.29
RPN6Q12377 BFR2YDR299W 1605 nt0.71□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 NHP2YDL208W 471 nt0.71□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 YDR102CYDR102C 333 nt0.7□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 SGF11YPL047W 300 nt0.7□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 YPL225WYPL225W 441 nt0.7□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 PMP1YCR024C-A 123 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 RPL26BYGR034W 384 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 PAM16YJL104W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 UBP3YER151C 2739 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 HMRA1YCR097W 381 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 GIM4YEL003W 336 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.68□□□□□ -2.3
RPN6Q12377 YNL211CYNL211C 261 nt0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.2 ms