Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.76□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YNL144CYNL144C 2223 nt1.76□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 SPO21YOL091W 1830 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 MCM10YIL150C 1716 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 snR74snR74 88 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 RPL31AYDL075W 342 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 VPS55YJR044C 423 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 RRT15YLR162W-A 189 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.75□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 RTP1YMR185W 2946 nt1.74□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YLL007CYLL007C 1998 nt1.74□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.74□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 MYO2YOR326W 4725 nt1.74□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YLR419WYLR419W 4308 nt1.74□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 CUL3YGR003W 2235 nt1.74□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 ISD11YER048W-A 285 nt1.73□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YIR044CYIR044C 186 nt1.73□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.73□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 COA6YMR244C-A 315 nt1.73□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.73□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 NUP192YJL039C 5052 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 OLI1Q0130 231 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YJL120WYJL120W 324 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 TMA7YLR262C-A 195 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 SGF11YPL047W 300 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 UTP21YLR409C 2820 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 YKU70YMR284W 1809 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 LRE1YCL051W 1752 nt1.72□□□□□ -2.13
LCB4Q12246 PAU3YCR104W 375 nt1.71□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YEL014CYEL014C 306 nt1.71□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.71□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 PTP2YOR208W 2253 nt1.71□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 Q0032Q0032 291 nt1.7□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.7□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YJR039WYJR039W 3366 nt1.7□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 CAT8YMR280C 4302 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 CTF4YPR135W 2784 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 PKH2YOL100W 3246 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YBR174CYBR174C 315 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 COG4YPR105C 2586 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 LHS1YKL073W 2646 nt1.68□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 SLI15YBR156C 2097 nt1.67□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YHR210CYHR210C 1026 nt1.67□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YOR376WYOR376W 369 nt1.67□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 SPO24YPR036W-A 204 nt1.67□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 ALK1YGL021W 2283 nt1.66□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YJL182CYJL182C 318 nt1.66□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.66□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 PBY1YBR094W 2262 nt1.66□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 SBE22YHR103W 2559 nt1.65□□□□□ -2.14
LCB4Q12246 ECM12YHR021W-A 456 nt1.65□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 COF1YLL050C 432 nt1.65□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.65□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 RAD50YNL250W 3939 nt1.65□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YGR151CYGR151C 336 nt1.64□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 ADR1YDR216W 3972 nt1.64□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 AHC1YOR023C 1701 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 PIP2YOR363C 2991 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 MON2YNL297C 4911 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 ULI1YFR026C 510 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YGL217CYGL217C 342 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 VPS15YBR097W 4365 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 TDA9YML081W 3756 nt1.63□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YDR521WYDR521W 336 nt1.62□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.62□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 HUG1YML058W-A 207 nt1.62□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 MEC1YBR136W 7107 nt1.62□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 STF2YGR008C 255 nt1.61□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 EMC5YIL027C 426 nt1.61□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YLR294CYLR294C 330 nt1.61□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.61□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YBR206WYBR206W 324 nt1.61□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 SMC4YLR086W 4257 nt1.6□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 AIM44YPL158C 2277 nt1.6□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 TBS1YBR150C 3285 nt1.6□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.59□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.59□□□□□ -2.15
LCB4Q12246 SXM1YDR395W 2835 nt1.59□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 IFH1YLR223C 3258 nt1.59□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 SLD3YGL113W 2007 nt1.59□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 SKI3YPR189W 4299 nt1.59□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 MSH3YCR092C 3057 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 UFD2YDL190C 2886 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 PKH3YDR466W 2697 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YJL150WYJL150W 303 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 CDC31YOR257W 486 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YOR345CYOR345C 351 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 SLX4YLR135W 2247 nt1.58□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 NUT1YGL151W 3399 nt1.57□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YLR140WYLR140W 327 nt1.57□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.57□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 snR52snR52 92 nt1.57□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 CHS1YNL192W 3396 nt1.56□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YDL196WYDL196W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YNL338WYNL338W 159 nt1.56□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 NCA2YPR155C 1851 nt1.55□□□□□ -2.16
LCB4Q12246 YJL022WYJL022W 309 nt1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.5 ms