Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 SPF1YEL031W 3648 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 PIP2YOR363C 2991 nt2.37□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 APL5YPL195W 2799 nt2.37□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 FIG4YNL325C 2640 nt2.37□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.37□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 AIM44YPL158C 2277 nt2.37□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 COY1YKL179C 2040 nt2.35□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YDR521WYDR521W 336 nt2.35□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.35□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 ALK1YGL021W 2283 nt2.35□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YDL118WYDL118W 381 nt2.34□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 HAL9YOL089C 3093 nt2.34□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 YNL144CYNL144C 2223 nt2.34□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 YOL098CYOL098C 3114 nt2.34□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.34□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SVL3YPL032C 2478 nt2.33□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SAP185YJL098W 3177 nt2.33□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 IFH1YLR223C 3258 nt2.33□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 KOG1YHR186C 4674 nt2.33□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 STH1YIL126W 4080 nt2.32□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SCP160YJL080C 3669 nt2.32□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 FRK1YPL141C 2598 nt2.32□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SLD3YGL113W 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 MSB1YOR188W 3414 nt2.32□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SAP190YKR028W 3102 nt2.31□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 YBR206WYBR206W 324 nt2.31□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 HSL1YKL101W 4557 nt2.3□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 TDA9YML081W 3756 nt2.3□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 PBY1YBR094W 2262 nt2.3□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SEY1YOR165W 2331 nt2.3□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 COG4YPR105C 2586 nt2.3□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SLI15YBR156C 2097 nt2.29□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 PKH2YOL100W 3246 nt2.29□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 STE11YLR362W 2154 nt2.29□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 HER1YOR227W 3741 nt2.28□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 SIR4YDR227W 4077 nt2.28□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 USO1YDL058W 5373 nt2.28□□□□□ -2.04
MCD1Q12158 PRP42YDR235W 1635 nt2.28□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 SEC63YOR254C 1992 nt2.27□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.26□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 YBL053WYBL053W 375 nt2.26□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 SFB2YNL049C 2631 nt2.26□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.26□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 SBE22YHR103W 2559 nt2.25□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.24□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.24□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 RGA1YOR127W 3024 nt2.23□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 UTP21YLR409C 2820 nt2.22□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 SPO24YPR036W-A 204 nt2.22□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 REV3YPL167C 4515 nt2.22□□□□□ -2.05
MCD1Q12158 SNU13YEL026W 381 nt2.21□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.21□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 UBR2YLR024C 5619 nt2.21□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 MSH6YDR097C 3729 nt2.21□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 IRC8YJL051W 2469 nt2.2□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 FKS1YLR342W 5631 nt2.2□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 TOR2YKL203C 7425 nt2.2□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 ADR1YDR216W 3972 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 ATG9YDL149W 2994 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 RPS30BYOR182C 192 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YPL044CYPL044C 549 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 DNF1YER166W 4716 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 NUT1YGL151W 3399 nt2.19□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 MYO4YAL029C 4416 nt2.18□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.18□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YNL205CYNL205C 423 nt2.18□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 PDR8YLR266C 2106 nt2.18□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 UTP22YGR090W 3714 nt2.17□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 MDS3YGL197W 4464 nt2.17□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 COX12YLR038C 252 nt2.17□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 INO80YGL150C 4470 nt2.17□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 TRM3YDL112W 4311 nt2.16□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 PAA1YDR071C 576 nt2.16□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.16□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 snR48snR48 113 nt2.16□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YLR419WYLR419W 4308 nt2.15□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 FAB1YFR019W 6837 nt2.15□□□□□ -2.06
MCD1Q12158 YJR039WYJR039W 3366 nt2.15□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 BRE1YDL074C 2103 nt2.15□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 YMR045CYMR045C 5268 nt2.14□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.14□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 snR85snR85 171 nt2.14□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 EMC5YIL027C 426 nt2.14□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 TFC3YAL001C 3483 nt2.14□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 UFD4YKL010C 4452 nt2.13□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 APL1YJR005W 2103 nt2.13□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 BPH1YCR032W 6504 nt2.13□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 YDL206WYDL206W 2289 nt2.13□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 MGA2YIR033W 3342 nt2.13□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 TTI1YKL033W 3117 nt2.12□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 RAD50YNL250W 3939 nt2.12□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 GCN2YDR283C 4980 nt2.11□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 ALY2YJL084C 3141 nt2.11□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 TBS1YBR150C 3285 nt2.11□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.1□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 TMA7YLR262C-A 195 nt2.1□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 LHS1YKL073W 2646 nt2.09□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.09□□□□□ -2.07
MCD1Q12158 YOR102WYOR102W 351 nt2.09□□□□□ -2.07
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