Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 CUL3YGR003W 2235 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 EST2YLR318W 2655 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 MPT5YGL178W 2580 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 AIM44YPL158C 2277 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 RPL34BYIL052C 366 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YJL015CYJL015C 285 nt1.63□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 PIK1YNL267W 3201 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 INA22YIR024C 651 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 AZF1YOR113W 2745 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 VIK1YPL253C 1944 nt1.62□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YCS4YLR272C 3531 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 CHS1YNL192W 3396 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 PKH2YOL100W 3246 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.61□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 CCH1YGR217W 6120 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 HMRA2YCR096C 360 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YDR366CYDR366C 399 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 PFD1YJL179W 330 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 ALY2YJL084C 3141 nt1.6□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 SSK2YNR031C 4740 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 PIP2YOR363C 2991 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 CSE2YNR010W 450 nt1.59□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 MMS4YBR098W 2076 nt1.59□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 YLL007CYLL007C 1998 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 IFH1YLR223C 3258 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 PTP2YOR208W 2253 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 CAT8YMR280C 4302 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 snR8snR8 190 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 GPG1YGL121C 381 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 YNL028WYNL028W 318 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 SWI4YER111C 3282 nt1.58□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 TRM732YMR259C 4263 nt1.57□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 FIG4YNL325C 2640 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 NUP188YML103C 4968 nt1.56□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 YDL206WYDL206W 2289 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 IRA1YBR140C 9279 nt1.55□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 SPC110YDR356W 2835 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 MSN5YDR335W 3675 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 YBR064WYBR064W 429 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 PBY1YBR094W 2262 nt1.54□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 YLL020CYLL020C 306 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 PET127YOR017W 2403 nt1.53□□□□□ -2.16
RRP6Q12149 POL5YEL055C 3069 nt1.53□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 SLD3YGL113W 2007 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YDR521WYDR521W 336 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 CDC31YOR257W 486 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 snR49snR49 165 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 FYV8YGR196C 2454 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 SET3YKR029C 2256 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.52□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 PDE2YOR360C 1581 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 APL3YBL037W 3078 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 SPO75YLL005C 2607 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 MDS3YGL197W 4464 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YGL052WYGL052W 306 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 RPS27BYHR021C 249 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 RPS25BYLR333C 327 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YOR015WYOR015W 360 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YOR218CYOR218C 420 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.51□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 SPO21YOL091W 1830 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 NUP145YGL092W 3954 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 STO1YMR125W 2586 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YMR321CYMR321C 318 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 CDC25YLR310C 4770 nt1.5□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 PAN2YGL094C 3348 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YGL041CYGL041C 204 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YJL120WYJL120W 324 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 IES4YOR189W 351 nt1.49□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 MSH3YCR092C 3057 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 SEC21YNL287W 2808 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YBR206WYBR206W 324 nt1.48□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 YAR009CYAR009C 3591 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 RRT15YLR162W-A 189 nt1.47□□□□□ -2.17
RRP6Q12149 snR55snR55 98 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.46□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 SEC3YER008C 4011 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 HKR1YDR420W 5409 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.45□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 snR80snR80 171 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 STF2YGR008C 255 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 YPR092WYPR092W 306 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 YGR130CYGR130C 2451 nt1.44□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 EAF1YDR359C 2949 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 MCM10YIL150C 1716 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 ABF2YMR072W 552 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.43□□□□□ -2.18
RRP6Q12149 RSM22YKL155C 1887 nt1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms