Protein–RNA interactions for Protein: Q12094

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TSR3Q12094 NUP157YER105C 4176 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 ANS1YHR126C 480 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 MDS3YGL197W 4464 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 NNF2YGR089W 2811 nt4.02□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 SET1YHR119W 3243 nt4.01□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 OSH2YDL019C 3852 nt4.01□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 BUD4YJR092W 4344 nt4.01□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 RPL26BYGR034W 384 nt4□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 SEC26YDR238C 2922 nt4□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 PDR3YBL005W 2931 nt4□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 XRS2YDR369C 2565 nt4□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 NUP159YIL115C 4383 nt3.99□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 YDR209CYDR209C 414 nt3.99□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 VPS16YPL045W 2397 nt3.99□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 AGC1YPR021C 2709 nt3.99□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 CHS1YNL192W 3396 nt3.99□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 BUD2YKL092C 3315 nt3.98□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 ROM2YLR371W 4071 nt3.98□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 POL3YDL102W 3294 nt3.98□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 YHR080CYHR080C 4038 nt3.98□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 UFD4YKL010C 4452 nt3.98□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 BPT1YLL015W 4680 nt3.97□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 SPC110YDR356W 2835 nt3.97□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 RPA135YPR010C 3612 nt3.96□□□□□ -1.77
TSR3Q12094 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.96□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.96□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 TAF2YCR042C 4224 nt3.94□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 SEY1YOR165W 2331 nt3.94□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 DAN4YJR151C 3486 nt3.93□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 LRG1YDL240W 3054 nt3.93□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 snR40snR40 97 nt3.93□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 COP1YDL145C 3606 nt3.93□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 EST2YLR318W 2655 nt3.92□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.92□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.92□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.92□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 SEG1YMR086W 2883 nt3.92□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 snR14snR14 160 nt3.91□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 SYT1YPR095C 3681 nt3.91□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 GCN2YDR283C 4980 nt3.91□□□□□ -1.78
TSR3Q12094 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.9□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 YOR055WYOR055W 435 nt3.9□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 SWR1YDR334W 4545 nt3.89□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 YER172C-AYER172C-A 381 nt3.89□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 TSC11YER093C 4293 nt3.89□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 TFC4YGR047C 3078 nt3.89□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 URA2YJL130C 6645 nt3.88□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 RGR1YLR071C 3249 nt3.87□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 SAC3YDR159W 3906 nt3.87□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 JSN1YJR091C 3276 nt3.86□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 SMC3YJL074C 3693 nt3.85□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 RPS28BYLR264W 204 nt3.85□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 BMS1YPL217C 3552 nt3.84□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 SPA2YLL021W 4401 nt3.84□□□□□ -1.79
TSR3Q12094 MDN1YLR106C 14733 nt3.83□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 FAS1YKL182W 6156 nt3.83□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 RDS3YPR094W 324 nt3.82□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 RAX2YLR084C 3663 nt3.82□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 BUB1YGR188C 3066 nt3.82□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 VPS8YAL002W 3825 nt3.81□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 YEL025CYEL025C 3567 nt3.79□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 RPS21AYKR057W 264 nt3.79□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 AUS1YOR011W 4185 nt3.78□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 SPO71YDR104C 3738 nt3.78□□□□□ -1.8
TSR3Q12094 PDR1YGL013C 3207 nt3.76□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 CIN8YEL061C 3003 nt3.76□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 ROM1YGR070W 3468 nt3.75□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.75□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 ATG26YLR189C 3597 nt3.74□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.74□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 TUS1YLR425W 3924 nt3.74□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 RRP5YMR229C 5190 nt3.73□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 HEF3YNL014W 3135 nt3.72□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 snR69snR69 101 nt3.72□□□□□ -1.81
TSR3Q12094 PKH3YDR466W 2697 nt3.71□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 PAN2YGL094C 3348 nt3.7□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 BUL2YML111W 2763 nt3.7□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 RTT101YJL047C 2529 nt3.7□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 SMC6YLR383W 3345 nt3.7□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 STE6YKL209C 3873 nt3.7□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 DSE4YNR067C 3354 nt3.69□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 ARO1YDR127W 4767 nt3.69□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 snR190snR190 190 nt3.69□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt3.69□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 NST1YNL091W 3723 nt3.69□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 AKR1YDR264C 2295 nt3.69□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 FLO5YHR211W 3228 nt3.68□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt3.68□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 GCN1YGL195W 8019 nt3.67□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 MET5YJR137C 4329 nt3.67□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 KRE5YOR336W 4098 nt3.66□□□□□ -1.82
TSR3Q12094 CBF2YGR140W 2871 nt3.65□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 TRL1YJL087C 2484 nt3.65□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 PMR1YGL167C 2853 nt3.65□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 YGR067CYGR067C 2415 nt3.64□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.63□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 CAT8YMR280C 4302 nt3.63□□□□□ -1.83
TSR3Q12094 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt3.63□□□□□ -1.83
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