Protein–RNA interactions for Protein: Q12024

YTM1, Ribosome biogenesis protein YTM1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTM1Q12024 CTF4YPR135W 2784 nt1.82□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 PKH2YOL100W 3246 nt1.82□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 CDC36YDL165W 576 nt1.81□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YDR521WYDR521W 336 nt1.81□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YPR092WYPR092W 306 nt1.81□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 IFH1YLR223C 3258 nt1.8□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YBR174CYBR174C 315 nt1.8□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 KIP1YBL063W 3336 nt1.8□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 NEO1YIL048W 3456 nt1.79□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 SMC4YLR086W 4257 nt1.79□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.79□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YOR376WYOR376W 369 nt1.79□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.79□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 YCS4YLR272C 3531 nt1.78□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 PBY1YBR094W 2262 nt1.78□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 SLX4YLR135W 2247 nt1.78□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 ALY2YJL084C 3141 nt1.78□□□□□ -2.12
YTM1Q12024 MYO2YOR326W 4725 nt1.78□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 NCA2YPR155C 1851 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 PEP1YBL017C 4740 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 GPG1YGL121C 381 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 VPS55YJR044C 423 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 TRM3YDL112W 4311 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 NPR2YEL062W 1848 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 KAP122YGL016W 3246 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 MCM10YIL150C 1716 nt1.77□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YOR093CYOR093C 4947 nt1.76□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.76□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 ADR1YDR216W 3972 nt1.75□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YLL054CYLL054C 2532 nt1.75□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YHR210CYHR210C 1026 nt1.75□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 JLP2YMR132C 627 nt1.75□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YBR206WYBR206W 324 nt1.75□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YLR140WYLR140W 327 nt1.74□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YOR019WYOR019W 2193 nt1.74□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 snR74snR74 88 nt1.73□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.73□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 PFD1YJL179W 330 nt1.73□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 RRT15YLR162W-A 189 nt1.73□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 SGF11YPL047W 300 nt1.73□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YDL206WYDL206W 2289 nt1.73□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 BST1YFL025C 3090 nt1.72□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 BLI1YKL061W 342 nt1.72□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 snR14snR14 160 nt1.72□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 VPS15YBR097W 4365 nt1.72□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 AIM44YPL158C 2277 nt1.71□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 MMS4YBR098W 2076 nt1.71□□□□□ -2.13
YTM1Q12024 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.71□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.7□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.7□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 DNF3YMR162C 4971 nt1.7□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 LRE1YCL051W 1752 nt1.7□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 PAN2YGL094C 3348 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 PIP2YOR363C 2991 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YOR302WYOR302W 78 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 RTP1YMR185W 2946 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 SAC3YDR159W 3906 nt1.69□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.68□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.68□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 AHC1YOR023C 1701 nt1.67□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 APQ12YIL040W 417 nt1.67□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 IRC20YLR247C 4671 nt1.67□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 YKU70YMR284W 1809 nt1.66□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.66□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 SLD3YGL113W 2007 nt1.66□□□□□ -2.14
YTM1Q12024 FIG4YNL325C 2640 nt1.65□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 PMD1YER132C 5262 nt1.65□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YLR422WYLR422W 5799 nt1.64□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 TRM732YMR259C 4263 nt1.64□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 ECM12YHR021W-A 456 nt1.64□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 SWI4YER111C 3282 nt1.64□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YAR009CYAR009C 3591 nt1.63□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.63□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.63□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 CFT1YDR301W 4074 nt1.63□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 EST2YLR318W 2655 nt1.62□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 SXM1YDR395W 2835 nt1.62□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.62□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 SET3YKR029C 2256 nt1.62□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 MDS3YGL197W 4464 nt1.62□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 ISD11YER048W-A 285 nt1.61□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 AZF1YOR113W 2745 nt1.61□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 STO1YMR125W 2586 nt1.6□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 APL3YBL037W 3078 nt1.6□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.59□□□□□ -2.15
YTM1Q12024 YDL196WYDL196W 330 nt1.58□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 OLI1Q0130 231 nt1.58□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 NUP188YML103C 4968 nt1.58□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 SBE22YHR103W 2559 nt1.57□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.57□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 PAM16YJL104W 450 nt1.57□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 NUP145YGL092W 3954 nt1.57□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 MSN5YDR335W 3675 nt1.55□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.55□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 MEC1YBR136W 7107 nt1.55□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 YLL020CYLL020C 306 nt1.54□□□□□ -2.16
YTM1Q12024 COA6YMR244C-A 315 nt1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.1 ms