Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YKU70YMR284W 1809 nt1.97□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 OLI1Q0130 231 nt1.97□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.97□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 YOR376WYOR376W 369 nt1.97□□□□□ -2.09
VHS3Q08438 PAU3YCR104W 375 nt1.96□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 GYP5YPL249C 2685 nt1.96□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 MCM10YIL150C 1716 nt1.96□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 INO80YGL150C 4470 nt1.95□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 RPL31AYDL075W 342 nt1.95□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 TMA7YLR262C-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.95□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 SEC63YOR254C 1992 nt1.95□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 IRC20YLR247C 4671 nt1.94□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 FRK1YPL141C 2598 nt1.94□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YJR039WYJR039W 3366 nt1.94□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YNL144CYNL144C 2223 nt1.94□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YEL014CYEL014C 306 nt1.93□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YGR151CYGR151C 336 nt1.93□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 SEC31YDL195W 3822 nt1.93□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 CUL3YGR003W 2235 nt1.93□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.92□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.92□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 PTP2YOR208W 2253 nt1.92□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 ECM12YHR021W-A 456 nt1.91□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.91□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.9□□□□□ -2.1
VHS3Q08438 SFB2YNL049C 2631 nt1.9□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YLL007CYLL007C 1998 nt1.9□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 MON2YNL297C 4911 nt1.9□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 PEP1YBL017C 4740 nt1.89□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YHR210CYHR210C 1026 nt1.89□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 LHS1YKL073W 2646 nt1.89□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 FAB1YFR019W 6837 nt1.88□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 DNF3YMR162C 4971 nt1.88□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 RTP1YMR185W 2946 nt1.88□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 LRE1YCL051W 1752 nt1.88□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YJL150WYJL150W 303 nt1.88□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.88□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 FIG2YCR089W 4830 nt1.87□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 UTP21YLR409C 2820 nt1.87□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YDR521WYDR521W 336 nt1.87□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YLR140WYLR140W 327 nt1.87□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 SLI15YBR156C 2097 nt1.87□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 ALK1YGL021W 2283 nt1.87□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.86□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 TBS1YBR150C 3285 nt1.86□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 COG4YPR105C 2586 nt1.86□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YGL217CYGL217C 342 nt1.85□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.85□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 NUT1YGL151W 3399 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 IFH1YLR223C 3258 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 ULI1YFR026C 510 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 COF1YLL050C 432 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 SPO24YPR036W-A 204 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 snR46snR46 197 nt1.84□□□□□ -2.11
VHS3Q08438 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.83□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 PKH2YOL100W 3246 nt1.83□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 PIP2YOR363C 2991 nt1.82□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 PBY1YBR094W 2262 nt1.82□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 EMC5YIL027C 426 nt1.82□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 TRM3YDL112W 4311 nt1.82□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 PRP39YML046W 1890 nt1.82□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 AHC1YOR023C 1701 nt1.81□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.81□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 YBR206WYBR206W 324 nt1.81□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 TRS65YGR166W 1683 nt1.8□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 KCS1YDR017C 3153 nt1.8□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 PKH3YDR466W 2697 nt1.8□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 YDL196WYDL196W 330 nt1.79□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 NCA2YPR155C 1851 nt1.79□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 AIM44YPL158C 2277 nt1.79□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 SKI3YPR189W 4299 nt1.79□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 YNL338WYNL338W 159 nt1.78□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 YOR345CYOR345C 351 nt1.78□□□□□ -2.12
VHS3Q08438 YCS4YLR272C 3531 nt1.77□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 ALY2YJL084C 3141 nt1.77□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 ADR1YDR216W 3972 nt1.77□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 SLD3YGL113W 2007 nt1.77□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 MDS3YGL197W 4464 nt1.77□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 FIG4YNL325C 2640 nt1.76□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.76□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 RAD50YNL250W 3939 nt1.75□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.75□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 UFD2YDL190C 2886 nt1.74□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 CTF4YPR135W 2784 nt1.74□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 HAL9YOL089C 3093 nt1.74□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 RPL33BYOR234C 324 nt1.73□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 SMC4YLR086W 4257 nt1.73□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 PMD1YER132C 5262 nt1.72□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 YDL206WYDL206W 2289 nt1.72□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 snR52snR52 92 nt1.72□□□□□ -2.13
VHS3Q08438 KIP1YBL063W 3336 nt1.71□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 PAN2YGL094C 3348 nt1.71□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.71□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 YOR019WYOR019W 2193 nt1.71□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.7□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 CFT1YDR301W 4074 nt1.7□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 SLX4YLR135W 2247 nt1.7□□□□□ -2.14
VHS3Q08438 SBE22YHR103W 2559 nt1.69□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 85.5 ms