Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 PNC1YGL037C 651 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 APL1YJR005W 2103 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 HMI1YOL095C 2121 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 SCP160YJL080C 3669 nt2.7□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 YNL144CYNL144C 2223 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 NEW1YPL226W 3591 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 GEA1YJR031C 4227 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 SAP185YJL098W 3177 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 PKH2YOL100W 3246 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 NAB6YML117W 3405 nt2.68□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 SAP1YER047C 2694 nt2.68□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 BCK1YJL095W 4437 nt2.68□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 TOR1YJR066W 7413 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 AGC1YPR021C 2709 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 YLL054CYLL054C 2532 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 BNR1YIL159W 4128 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 YGL182CYGL182C 324 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 FLO11YIR019C 4104 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 DNA2YHR164C 4569 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 IRC8YJL051W 2469 nt2.65□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 CTR9YOL145C 3234 nt2.65□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 SRB8YCR081W 4284 nt2.65□□□□□ -1.98
HDA3Q06623 RPS29AYLR388W 171 nt2.65□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YPL150WYPL150W 2706 nt2.65□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 COG4YPR105C 2586 nt2.64□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 STE11YLR362W 2154 nt2.64□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 SLI15YBR156C 2097 nt2.64□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YDR209CYDR209C 414 nt2.64□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 UBP15YMR304W 3693 nt2.64□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.63□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 FAR11YNL127W 2862 nt2.63□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 SEC26YDR238C 2922 nt2.63□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 TRL1YJL087C 2484 nt2.62□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.62□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 UBR1YGR184C 5853 nt2.62□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.62□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 MLH1YMR167W 2310 nt2.62□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 SSD1YDR293C 3753 nt2.61□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 snR70snR70 164 nt2.61□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YLL020CYLL020C 306 nt2.61□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 SGS1YMR190C 4344 nt2.61□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 LHS1YKL073W 2646 nt2.61□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.61□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 CDC60YPL160W 3273 nt2.6□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 UBP1YDL122W 2430 nt2.6□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.6□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.6□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 UTP8YGR128C 2142 nt2.59□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 ADR1YDR216W 3972 nt2.59□□□□□ -1.99
HDA3Q06623 SYH1YPL105C 2550 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 YDL206WYDL206W 2289 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 PET309YLR067C 2898 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 LCL1YPL056C 306 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 TOP2YNL088W 4287 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 IRE1YHR079C 3348 nt2.58□□□□□ -2
HDA3Q06623 QCR9YGR183C 201 nt2.57□□□□□ -2
HDA3Q06623 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.57□□□□□ -2
HDA3Q06623 PDR1YGL013C 3207 nt2.57□□□□□ -2
HDA3Q06623 RTT107YHR154W 3213 nt2.57□□□□□ -2
HDA3Q06623 TRM3YDL112W 4311 nt2.56□□□□□ -2
HDA3Q06623 STB6YKL072W 2301 nt2.56□□□□□ -2
HDA3Q06623 RPL37BYDR500C 267 nt2.55□□□□□ -2
HDA3Q06623 TDA9YML081W 3756 nt2.54□□□□□ -2
HDA3Q06623 YJR039WYJR039W 3366 nt2.54□□□□□ -2
HDA3Q06623 UFD2YDL190C 2886 nt2.54□□□□□ -2
HDA3Q06623 GCN2YDR283C 4980 nt2.53□□□□□ -2
HDA3Q06623 BFR2YDR299W 1605 nt2.53□□□□□ -2
HDA3Q06623 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.53□□□□□ -2
HDA3Q06623 IST2YBR086C 2841 nt2.53□□□□□ -2
HDA3Q06623 FRK1YPL141C 2598 nt2.53□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.52□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.52□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 PDR3YBL005W 2931 nt2.52□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 ARP8YOR141C 2646 nt2.52□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 KRE33YNL132W 3171 nt2.51□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.51□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 FKS3YMR306W 5358 nt2.51□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 YOR055WYOR055W 435 nt2.5□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 snR45snR45 172 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 POL5YEL055C 3069 nt2.49□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 SGM1YJR134C 2124 nt2.48□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 SLN1YIL147C 3663 nt2.48□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 GIP3YPL137C 3831 nt2.48□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 snR39BsnR39B 96 nt2.48□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 TBS1YBR150C 3285 nt2.48□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 IRA2YOL081W 9240 nt2.48□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 PSD2YGR170W 3417 nt2.47□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 RCO1YMR075W 2055 nt2.47□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 RSM22YKL155C 1887 nt2.47□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 RTT101YJL047C 2529 nt2.46□□□□□ -2.01
HDA3Q06623 SEC63YOR254C 1992 nt2.46□□□□□ -2.02
HDA3Q06623 COX5BYIL111W 456 nt2.45□□□□□ -2.02
HDA3Q06623 RAV1YJR033C 4074 nt2.45□□□□□ -2.02
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