Protein–RNA interactions for Protein: Q03770

SSY1, SPS-sensor component SSY1, yeastyeast

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSY1Q03770 CHS6YJL099W 2241 nt2.34□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 TOP2YNL088W 4287 nt2.34□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YDR521WYDR521W 336 nt2.33□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.33□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 snR70snR70 164 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.32□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 TOR1YJR066W 7413 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 ALK1YGL021W 2283 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 SMC6YLR383W 3345 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 VPS8YAL002W 3825 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 FAR11YNL127W 2862 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 TTI1YKL033W 3117 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 SAP190YKR028W 3102 nt2.31□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.3□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 RPS29AYLR388W 171 nt2.3□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YNL018CYNL018C 1839 nt2.3□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 MAK10YEL053C 2202 nt2.3□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YNL144CYNL144C 2223 nt2.3□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 UBP15YMR304W 3693 nt2.29□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 DNA2YHR164C 4569 nt2.29□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 ARP8YOR141C 2646 nt2.28□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 YLL054CYLL054C 2532 nt2.28□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 PDR1YGL013C 3207 nt2.28□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 MLH3YPL164C 2148 nt2.28□□□□□ -2.04
SSY1Q03770 NEW1YPL226W 3591 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 MET18YIL128W 3099 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 TOF1YNL273W 3717 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 MSH5YDL154W 2706 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 STE11YLR362W 2154 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 SEC16YPL085W 6588 nt2.26□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 PDR11YIL013C 4236 nt2.25□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 IRC8YJL051W 2469 nt2.25□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YGL182CYGL182C 324 nt2.25□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 snR45snR45 172 nt2.25□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 KRE33YNL132W 3171 nt2.25□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 APL1YJR005W 2103 nt2.24□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 SAP185YJL098W 3177 nt2.24□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.24□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 HMI1YOL095C 2121 nt2.24□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YPP1YGR198W 2454 nt2.23□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 TRS130YMR218C 3309 nt2.23□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.23□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 PKH2YOL100W 3246 nt2.22□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 NUP170YBL079W 4509 nt2.22□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 SVL3YPL032C 2478 nt2.22□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.22□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 PDR3YBL005W 2931 nt2.22□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 BNI1YNL271C 5862 nt2.22□□□□□ -2.05
SSY1Q03770 TUS1YLR425W 3924 nt2.21□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 LHS1YKL073W 2646 nt2.21□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 STH1YIL126W 4080 nt2.21□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 NAB6YML117W 3405 nt2.21□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 BUD2YKL092C 3315 nt2.2□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 QCR9YGR183C 201 nt2.2□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 NUP100YKL068W 2880 nt2.2□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 STB6YKL072W 2301 nt2.2□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 RCO1YMR075W 2055 nt2.19□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 UBP1YDL122W 2430 nt2.19□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.19□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 COG4YPR105C 2586 nt2.19□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 AGC1YPR021C 2709 nt2.19□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.18□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.18□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 YLL020CYLL020C 306 nt2.18□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 UBR1YGR184C 5853 nt2.18□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 SCP160YJL080C 3669 nt2.18□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 SLI15YBR156C 2097 nt2.18□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 VPS13YLL040C 9435 nt2.17□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 YOL098CYOL098C 3114 nt2.17□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.17□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 UTP8YGR128C 2142 nt2.15□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 SCD5YOR329C 2619 nt2.15□□□□□ -2.06
SSY1Q03770 snR39BsnR39B 96 nt2.15□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 YDL206WYDL206W 2289 nt2.14□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 TIM9YEL020W-A 264 nt2.14□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.14□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 CTR9YOL145C 3234 nt2.14□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 DNF1YER166W 4716 nt2.14□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 RAV1YJR033C 4074 nt2.14□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 BFR2YDR299W 1605 nt2.13□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 snR81snR81 201 nt2.13□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 RPL37BYDR500C 267 nt2.13□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 MDS3YGL197W 4464 nt2.13□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 TRL1YJL087C 2484 nt2.13□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.12□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 MSB1YOR188W 3414 nt2.12□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 SSD1YDR293C 3753 nt2.12□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 ADR1YDR216W 3972 nt2.12□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 UFD2YDL190C 2886 nt2.12□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 IST2YBR086C 2841 nt2.11□□□□□ -2.07
SSY1Q03770 SEC63YOR254C 1992 nt2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11 ms