Protein–RNA interactions for Protein: P40344

ATG3, Autophagy-related protein 3, yeastyeast

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG3P40344 SRB8YCR081W 4284 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG3P40344 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG3P40344 NUP100YKL068W 2880 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG3P40344 MDS3YGL197W 4464 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG3P40344 TTI1YKL033W 3117 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG3P40344 YOR055WYOR055W 435 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG3P40344 YOR019WYOR019W 2193 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG3P40344 CHC1YGL206C 4962 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG3P40344 PRP5YBR237W 2550 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG3P40344 PSD2YGR170W 3417 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 FAR11YNL127W 2862 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 YLL054CYLL054C 2532 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG3P40344 MBB1YJL199C 327 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG3P40344 RPS29AYLR388W 171 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG3P40344 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG3P40344 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG3P40344 AGC1YPR021C 2709 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG3P40344 NUM1YDR150W 8247 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG3P40344 COG4YPR105C 2586 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG3P40344 SOM1YEL059C-A 225 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG3P40344 PKH2YOL100W 3246 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 GIP3YPL137C 3831 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 RAV1YJR033C 4074 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG3P40344 CHS6YJL099W 2241 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG3P40344 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG3P40344 TOP2YNL088W 4287 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG3P40344 UBP15YMR304W 3693 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG3P40344 STE11YLR362W 2154 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG3P40344 SYH1YPL105C 2550 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 NAB6YML117W 3405 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 RTT107YHR154W 3213 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 MLH1YMR167W 2310 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 TRL1YJL087C 2484 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 APL1YJR005W 2103 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 YEF3YLR249W 3135 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 UBP1YDL122W 2430 nt2.66□□□□□ -1.98
ATG3P40344 STB6YKL072W 2301 nt2.65□□□□□ -1.98
ATG3P40344 SCP160YJL080C 3669 nt2.65□□□□□ -1.98
ATG3P40344 HIR3YJR140C 4947 nt2.65□□□□□ -1.99
ATG3P40344 IRC8YJL051W 2469 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG3P40344 POL5YEL055C 3069 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YGL182CYGL182C 324 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG3P40344 SVL3YPL032C 2478 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YJR039WYJR039W 3366 nt2.64□□□□□ -1.99
ATG3P40344 LHS1YKL073W 2646 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG3P40344 RPL37BYDR500C 267 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG3P40344 SLI15YBR156C 2097 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG3P40344 CTR9YOL145C 3234 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG3P40344 BUD2YKL092C 3315 nt2.63□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YNL144CYNL144C 2223 nt2.62□□□□□ -1.99
ATG3P40344 STF2YGR008C 255 nt2.62□□□□□ -1.99
ATG3P40344 MSB1YOR188W 3414 nt2.61□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YLR419WYLR419W 4308 nt2.6□□□□□ -1.99
ATG3P40344 KRE33YNL132W 3171 nt2.6□□□□□ -1.99
ATG3P40344 TOR1YJR066W 7413 nt2.6□□□□□ -1.99
ATG3P40344 SGS1YMR190C 4344 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG3P40344 YDL206WYDL206W 2289 nt2.59□□□□□ -1.99
ATG3P40344 FKS3YMR306W 5358 nt2.59□□□□□ -2
ATG3P40344 RCO1YMR075W 2055 nt2.59□□□□□ -2
ATG3P40344 CDC60YPL160W 3273 nt2.58□□□□□ -2
ATG3P40344 EAF1YDR359C 2949 nt2.58□□□□□ -2
ATG3P40344 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.58□□□□□ -2
ATG3P40344 FRK1YPL141C 2598 nt2.57□□□□□ -2
ATG3P40344 SGM1YJR134C 2124 nt2.57□□□□□ -2
ATG3P40344 UFD2YDL190C 2886 nt2.56□□□□□ -2
ATG3P40344 SLN1YIL147C 3663 nt2.56□□□□□ -2
ATG3P40344 TRM3YDL112W 4311 nt2.56□□□□□ -2
ATG3P40344 BFR2YDR299W 1605 nt2.56□□□□□ -2
ATG3P40344 SPF1YEL031W 3648 nt2.56□□□□□ -2
ATG3P40344 SSD1YDR293C 3753 nt2.56□□□□□ -2
ATG3P40344 ADR1YDR216W 3972 nt2.55□□□□□ -2
ATG3P40344 IRA2YOL081W 9240 nt2.55□□□□□ -2
ATG3P40344 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.55□□□□□ -2
ATG3P40344 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.55□□□□□ -2
ATG3P40344 IST2YBR086C 2841 nt2.55□□□□□ -2
ATG3P40344 snR39BsnR39B 96 nt2.55□□□□□ -2
ATG3P40344 QCR9YGR183C 201 nt2.54□□□□□ -2
ATG3P40344 YLL020CYLL020C 306 nt2.54□□□□□ -2
ATG3P40344 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.53□□□□□ -2
ATG3P40344 VPS13YLL040C 9435 nt2.53□□□□□ -2
ATG3P40344 DNF1YER166W 4716 nt2.53□□□□□ -2
ATG3P40344 YPR097WYPR097W 3222 nt2.53□□□□□ -2.01
ATG3P40344 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG3P40344 TDA9YML081W 3756 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG3P40344 DNA2YHR164C 4569 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG3P40344 NUT1YGL151W 3399 nt2.52□□□□□ -2.01
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