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Protein–RNA interactions for Protein: P40077
DSE1, Protein DSE1, yeast
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573 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
DSE1
P40077
NUP157
YER105C
4176 nt
0.99
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
FIG4
YNL325C
2640 nt
0.99
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
RPS20
YHL015W
366 nt
0.99
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
YBR200W-A
YBR200W-A
165 nt
0.99
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
RIM20
YOR275C
1986 nt
0.99
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
UBP3
YER151C
2739 nt
0.99
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
SET3
YKR029C
2256 nt
0.98
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
YPR002C-A
YPR002C-A
198 nt
0.98
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
RAD34
YDR314C
2079 nt
0.98
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
DOP1
YDR141C
5097 nt
0.97
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
PDE2
YOR360C
1581 nt
0.97
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
PCC1
YKR095W-A
267 nt
0.97
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
YBR221W-A
YBR221W-A
105 nt
0.97
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
PAN2
YGL094C
3348 nt
0.97
□□□□□ -2.25
DSE1
P40077
YDR118W-A
YDR118W-A
117 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YDR426C
YDR426C
378 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YIR044C
YIR044C
186 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YAL063C-A
YAL063C-A
291 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YAR053W
YAR053W
297 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YOR029W
YOR029W
336 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
RPS30B
YOR182C
192 nt
0.96
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YGR035C
YGR035C
351 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YPR170W-A
YPR170W-A
186 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
KAP120
YPL125W
3099 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
PKH2
YOL100W
3246 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
CDC39
YCR093W
6327 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
SMC1
YFL008W
3678 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
STO1
YMR125W
2586 nt
0.95
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
GPG1
YGL121C
381 nt
0.94
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
PAU24
YBR301W
363 nt
0.94
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
CUL3
YGR003W
2235 nt
0.94
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
SLD3
YGL113W
2007 nt
0.94
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YDL206W
YDL206W
2289 nt
0.94
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
MAM33
YIL070C
801 nt
0.93
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YIL142C-A
YIL142C-A
333 nt
0.93
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YJR029W
YJR029W
5268 nt
0.93
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YPR137C-B
YPR137C-B
5268 nt
0.93
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
IFH1
YLR223C
3258 nt
0.93
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
CSN9
YDR179C
489 nt
0.92
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
PAM16
YJL104W
450 nt
0.92
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
BIL1
YOR304C-A
231 nt
0.92
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
YPR012W
YPR012W
255 nt
0.92
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
NIP100
YPL174C
2607 nt
0.92
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
OST1
YJL002C
1431 nt
0.9
□□□□□ -2.26
DSE1
P40077
tW(UCA)Q
tW(UCA)Q
74 nt
0.9
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
INA22
YIR024C
651 nt
0.9
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
YBL008W-A
YBL008W-A
240 nt
0.89
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
PTP2
YOR208W
2253 nt
0.89
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
WAR1
YML076C
2835 nt
0.88
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
YLL007C
YLL007C
1998 nt
0.88
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
YJR011C
YJR011C
786 nt
0.88
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
YLR334C
YLR334C
381 nt
0.87
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
RPL35A
YDL191W
363 nt
0.86
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
YAR029W
YAR029W
225 nt
0.86
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
HTB2
YBL002W
396 nt
0.86
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
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YDR521W
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□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
YHL042W
YHL042W
453 nt
0.84
□□□□□ -2.27
DSE1
P40077
PRP16
YKR086W
3216 nt
0.83
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
ISD11
YER048W-A
285 nt
0.83
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DSE1
P40077
YPR016W-A
YPR016W-A
261 nt
0.83
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
HMRA2
YCR096C
360 nt
0.82
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YHL046W-A
327 nt
0.82
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
YCK3
YER123W
1575 nt
0.82
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
SEC1
YDR164C
2175 nt
0.81
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
GEA2
YEL022W
4380 nt
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YDL073W
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
NHP2
YDL208W
471 nt
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
YHR007C-A
YHR007C-A
216 nt
0.81
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YBR206W
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0.81
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YDL196W
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0.8
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
TAR1
YLR154W-C
375 nt
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YPR197C
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0.8
□□□□□ -2.28
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P40077
UTP20
YBL004W
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
YDR048C
YDR048C
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
CMC4
YMR194C-B
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YBR064W
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0.79
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)B
tT(AGU)B
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)C
tT(AGU)C
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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tT(AGU)D
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)H
tT(AGU)H
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)I1
tT(AGU)I1
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)J
tT(AGU)J
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)N1
tT(AGU)N1
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)N2
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)O1
tT(AGU)O1
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
tT(AGU)O2
tT(AGU)O2
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0.78
□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
YOR282W
YOR282W
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
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YPL038W-A
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□□□□□ -2.28
DSE1
P40077
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.76
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
DBP6
YNR038W
1890 nt
0.76
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
ALG13
YGL047W
609 nt
0.76
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
OLI1
Q0130
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0.76
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
RPS25B
YLR333C
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0.76
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YAF9
YNL107W
681 nt
0.76
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
LTE1
YAL024C
4308 nt
0.75
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
HMRA1
YCR097W
381 nt
0.75
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
ECM12
YHR021W-A
456 nt
0.75
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YJL120W
YJL120W
324 nt
0.74
□□□□□ -2.29
DSE1
P40077
YOR011W-A
YOR011W-A
207 nt
0.74
□□□□□ -2.29
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