Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 YOL160WYOL160W 342 nt0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 LEE1YPL054W 906 nt0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YBR206WYBR206W 324 nt0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 CUL3YGR003W 2235 nt0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YCR001WYCR001W 315 nt0□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 SEM1YDR363W-A 270 nt0□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 RPS27AYKL156W 249 nt0□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 TSC3YBR058C-A 243 nt0□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 DCP1YOL149W 696 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 SVS1YPL163C 783 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 snR51snR51 107 nt-0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 BIR1YJR089W 2865 nt-0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 WIP1YDR374W-A 270 nt-0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 COX5BYIL111W 456 nt-0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YDL016CYDL016C 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 BER1YLR412W 825 nt-0.03□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 PRP42YDR235W 1635 nt-0.03□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 RCO1YMR075W 2055 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YAP6YDR259C 1152 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 TIM13YGR181W 318 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YHL041WYHL041W 450 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 MAM33YIL070C 801 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YJR011CYJR011C 786 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YML108WYML108W 318 nt-0.04□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 OST4YDL232W 111 nt-0.05□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 SDH7YDR511W 402 nt-0.05□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YKL202WYKL202W 582 nt-0.05□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YLR269CYLR269C 351 nt-0.05□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YNL211CYNL211C 261 nt-0.05□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YOR053WYOR053W 342 nt-0.05□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 SSS1YDR086C 243 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 RPF1YHR088W 888 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 NFU1YKL040C 771 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YLR171WYLR171W 390 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YOR345CYOR345C 351 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YPL182CYPL182C 384 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YPL261CYPL261C 309 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 snR190snR190 190 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.06□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-0.07□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 MATALPHA2YCR039C 633 nt-0.07□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 RPS26AYGL189C 360 nt-0.07□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 HUG1YML058W-A 207 nt-0.07□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt-0.08□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 PBI2YNL015W 228 nt-0.08□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 HAL9YOL089C 3093 nt-0.08□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 YLR232WYLR232W 348 nt-0.09□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 COG8YML071C 1824 nt-0.09□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 SPO21YOL091W 1830 nt-0.09□□□□□ -2.42
YHR140WP38842 PAA1YDR071C 576 nt-0.1□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.1□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 GPI15YNL038W 690 nt-0.1□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YNL146WYNL146W 303 nt-0.1□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt-0.11□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YIR044CYIR044C 186 nt-0.11□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-0.11□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-0.11□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 SGF11YPL047W 300 nt-0.11□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YPL185WYPL185W 396 nt-0.11□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YBL071CYBL071C 309 nt-0.12□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 MRPL50YNR022C 420 nt-0.12□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 STE5YDR103W 2754 nt-0.12□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 RPL35AYDL191W 363 nt-0.13□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 NNF2YGR089W 2811 nt-0.13□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 COY1YKL179C 2040 nt-0.13□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 PTP2YOR208W 2253 nt-0.13□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 ULI1YFR026C 510 nt-0.14□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.14□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YOL014WYOL014W 375 nt-0.14□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-0.14□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YDL011CYDL011C 324 nt-0.15□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 RPS20YHL015W 366 nt-0.15□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.15□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 Q0255Q0255 1419 nt-0.15□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 SOV1YMR066W 2697 nt-0.16□□□□□ -2.43
YHR140WP38842 ATG31YDR022C 591 nt-0.16□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YKL083WYKL083W 615 nt-0.16□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.16□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YNL058CYNL058C 951 nt-0.16□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 NIP100YPL174C 2607 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 YPL229WYPL229W 621 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 THO2YNL139C 4794 nt-0.18□□□□□ -2.44
YHR140WP38842 NIP1YMR309C 2439 nt-0.19□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 71.5 ms