Protein–RNA interactions for Protein: P22141

PRE1, Proteasome subunit beta type-4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRE1P22141 YJR011CYJR011C 786 nt0.13□□□□□ -2.39
PRE1P22141 YPL182CYPL182C 384 nt0.13□□□□□ -2.39
PRE1P22141 snR51snR51 107 nt0.13□□□□□ -2.39
PRE1P22141 UTP20YBL004W 7482 nt0.13□□□□□ -2.39
PRE1P22141 SEC8YPR055W 3198 nt0.12□□□□□ -2.39
PRE1P22141 YCR001WYCR001W 315 nt0.12□□□□□ -2.39
PRE1P22141 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 INP2YMR163C 2118 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 PRP5YBR237W 2550 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 SDH7YDR511W 402 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 YGR290WYGR290W 444 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 PET111YMR257C 2403 nt0.11□□□□□ -2.39
PRE1P22141 NIP100YPL174C 2607 nt0.1□□□□□ -2.39
PRE1P22141 RPF1YHR088W 888 nt0.1□□□□□ -2.39
PRE1P22141 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.1□□□□□ -2.39
PRE1P22141 ULP2YIL031W 3105 nt0.1□□□□□ -2.39
PRE1P22141 RPS20YHL015W 366 nt0.09□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.09□□□□□ -2.4
PRE1P22141 RPS27AYKL156W 249 nt0.09□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.09□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YDL011CYDL011C 324 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YAP6YDR259C 1152 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 RPL26AYLR344W 384 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YML108WYML108W 318 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 GPI15YNL038W 690 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt0.08□□□□□ -2.4
PRE1P22141 VIK1YPL253C 1944 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 OST4YDL232W 111 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YHL041WYHL041W 450 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 MAM33YIL070C 801 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YPL185WYPL185W 396 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 IQG1YPL242C 4488 nt0.07□□□□□ -2.4
PRE1P22141 RCO1YMR075W 2055 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 ORC3YLL004W 1851 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 AI1Q0050 2505 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YIR044CYIR044C 186 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YBL071CYBL071C 309 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 RPS30BYOR182C 192 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YOR345CYOR345C 351 nt0.06□□□□□ -2.4
PRE1P22141 HAL9YOL089C 3093 nt0.05□□□□□ -2.4
PRE1P22141 CUL3YGR003W 2235 nt0.05□□□□□ -2.4
PRE1P22141 PBI2YNL015W 228 nt0.04□□□□□ -2.4
PRE1P22141 YNL211CYNL211C 261 nt0.04□□□□□ -2.4
PRE1P22141 ATG31YDR022C 591 nt0.03□□□□□ -2.4
PRE1P22141 PRP42YDR235W 1635 nt0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YLR171WYLR171W 390 nt0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 COX5BYIL111W 456 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YKL123WYKL123W 381 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 AIM29YKR074W 468 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YMR321CYMR321C 318 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 ZEO1YOL109W 342 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 LEE1YPL054W 906 nt0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 BIR1YJR089W 2865 nt-0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 RPS26AYGL189C 360 nt-0.01□□□□□ -2.41
PRE1P22141 PAA1YDR071C 576 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YLR287CYLR287C 1068 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YNL319WYNL319W 441 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YOR053WYOR053W 342 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YPL229WYPL229W 621 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 PTP2YOR208W 2253 nt-0.02□□□□□ -2.41
PRE1P22141 SPO21YOL091W 1830 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 STF2YGR008C 255 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 STE18YJR086W 333 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 TAR1YLR154W-C 375 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 YNL146WYNL146W 303 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 COY1YKL179C 2040 nt-0.03□□□□□ -2.41
PRE1P22141 snR78snR78 87 nt-0.04□□□□□ -2.42
PRE1P22141 YHR125WYHR125W 306 nt-0.04□□□□□ -2.42
PRE1P22141 YKL083WYKL083W 615 nt-0.04□□□□□ -2.42
PRE1P22141 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.04□□□□□ -2.42
PRE1P22141 YNL058CYNL058C 951 nt-0.04□□□□□ -2.42
PRE1P22141 MLP1YKR095W 5628 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 CBS1YDL069C 690 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 snR190snR190 190 nt-0.05□□□□□ -2.42
PRE1P22141 SOV1YMR066W 2697 nt-0.06□□□□□ -2.42
PRE1P22141 EAF6YJR082C 342 nt-0.06□□□□□ -2.42
PRE1P22141 ISF1YMR081C 1017 nt-0.06□□□□□ -2.42
PRE1P22141 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-0.06□□□□□ -2.42
PRE1P22141 DIE2YGR227W 1578 nt-0.06□□□□□ -2.42
PRE1P22141 STE5YDR103W 2754 nt-0.07□□□□□ -2.42
PRE1P22141 BUL2YML111W 2763 nt-0.07□□□□□ -2.42
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