Protein–RNA interactions for Protein: P20485

CKI1, Choline kinase, yeastyeast

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CKI1P20485 CDC39YCR093W 6327 nt1.01□□□□□ -2.25
CKI1P20485 IFH1YLR223C 3258 nt1.01□□□□□ -2.25
CKI1P20485 PKH2YOL100W 3246 nt1.01□□□□□ -2.25
CKI1P20485 RIM20YOR275C 1986 nt1.01□□□□□ -2.25
CKI1P20485 YDL206WYDL206W 2289 nt1□□□□□ -2.25
CKI1P20485 YER137W-AYER137W-A 306 nt1□□□□□ -2.25
CKI1P20485 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1□□□□□ -2.25
CKI1P20485 IRC23YOR044W 474 nt1□□□□□ -2.25
CKI1P20485 YOR121CYOR121C 306 nt1□□□□□ -2.25
CKI1P20485 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1□□□□□ -2.25
CKI1P20485 PAN2YGL094C 3348 nt0.99□□□□□ -2.25
CKI1P20485 CUL3YGR003W 2235 nt0.99□□□□□ -2.25
CKI1P20485 NUP157YER105C 4176 nt0.99□□□□□ -2.25
CKI1P20485 PCC1YKR095W-A 267 nt0.98□□□□□ -2.25
CKI1P20485 MAM33YIL070C 801 nt0.97□□□□□ -2.25
CKI1P20485 YAR009CYAR009C 3591 nt0.97□□□□□ -2.25
CKI1P20485 WAR1YML076C 2835 nt0.96□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YDR426CYDR426C 378 nt0.96□□□□□ -2.26
CKI1P20485 PAU24YBR301W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
CKI1P20485 NIP100YPL174C 2607 nt0.96□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YDR157WYDR157W 402 nt0.95□□□□□ -2.26
CKI1P20485 PTP2YOR208W 2253 nt0.94□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.94□□□□□ -2.26
CKI1P20485 KAP120YPL125W 3099 nt0.93□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YLL007CYLL007C 1998 nt0.93□□□□□ -2.26
CKI1P20485 SMC1YFL008W 3678 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.92□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YHL042WYHL042W 453 nt0.91□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YJR011CYJR011C 786 nt0.91□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt0.91□□□□□ -2.26
CKI1P20485 YAR053WYAR053W 297 nt0.91□□□□□ -2.26
CKI1P20485 UBP3YER151C 2739 nt0.91□□□□□ -2.26
CKI1P20485 CSN9YDR179C 489 nt0.89□□□□□ -2.27
CKI1P20485 YDR521WYDR521W 336 nt0.88□□□□□ -2.27
CKI1P20485 STF2YGR008C 255 nt0.88□□□□□ -2.27
CKI1P20485 YGR035CYGR035C 351 nt0.88□□□□□ -2.27
CKI1P20485 YFL019CYFL019C 354 nt0.87□□□□□ -2.27
CKI1P20485 BIL1YOR304C-A 231 nt0.87□□□□□ -2.27
CKI1P20485 YDL196WYDL196W 330 nt0.86□□□□□ -2.27
CKI1P20485 ISD11YER048W-A 285 nt0.85□□□□□ -2.27
CKI1P20485 YOR029WYOR029W 336 nt0.85□□□□□ -2.27
CKI1P20485 GEA2YEL022W 4380 nt0.85□□□□□ -2.27
CKI1P20485 HMRA2YCR096C 360 nt0.84□□□□□ -2.27
CKI1P20485 OST1YJL002C 1431 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YAR029WYAR029W 225 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 HTB2YBL002W 396 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 HUG1YML058W-A 207 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YBR206WYBR206W 324 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 DBP6YNR038W 1890 nt0.83□□□□□ -2.28
CKI1P20485 RPL35AYDL191W 363 nt0.82□□□□□ -2.28
CKI1P20485 NHP2YDL208W 471 nt0.82□□□□□ -2.28
CKI1P20485 ALG13YGL047W 609 nt0.82□□□□□ -2.28
CKI1P20485 PRP16YKR086W 3216 nt0.82□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YCK3YER123W 1575 nt0.82□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.81□□□□□ -2.28
CKI1P20485 PAM16YJL104W 450 nt0.81□□□□□ -2.28
CKI1P20485 IES4YOR189W 351 nt0.81□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YOR282WYOR282W 321 nt0.81□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YBR064WYBR064W 429 nt0.81□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YDL073WYDL073W 2955 nt0.8□□□□□ -2.28
CKI1P20485 OLI1Q0130 231 nt0.8□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt0.8□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YLR334CYLR334C 381 nt0.79□□□□□ -2.28
CKI1P20485 YPL044CYPL044C 549 nt0.79□□□□□ -2.28
CKI1P20485 SEC1YDR164C 2175 nt0.77□□□□□ -2.29
CKI1P20485 CMC4YMR194C-B 222 nt0.77□□□□□ -2.29
CKI1P20485 SPO21YOL091W 1830 nt0.77□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YDR344CYDR344C 444 nt0.76□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.76□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YPR012WYPR012W 255 nt0.76□□□□□ -2.29
CKI1P20485 PAA1YDR071C 576 nt0.75□□□□□ -2.29
CKI1P20485 ECM12YHR021W-A 456 nt0.75□□□□□ -2.29
CKI1P20485 RPS25BYLR333C 327 nt0.75□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.75□□□□□ -2.29
CKI1P20485 MCM10YIL150C 1716 nt0.75□□□□□ -2.29
CKI1P20485 NOP9YJL010C 2001 nt0.74□□□□□ -2.29
CKI1P20485 PMP1YCR024C-A 123 nt0.74□□□□□ -2.29
CKI1P20485 TAR1YLR154W-C 375 nt0.74□□□□□ -2.29
CKI1P20485 BFR2YDR299W 1605 nt0.74□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YDR048CYDR048C 315 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.73□□□□□ -2.29
CKI1P20485 YJL120WYJL120W 324 nt0.73□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51.1 ms