Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prf1P10820 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prf1P10820 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prf1P10820 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prf1P10820 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms