Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Rnft1Q9DCN7 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Rnft1Q9DCN7 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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