Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpv2Q9WTR1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpv2Q9WTR1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms