Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Edf1Q9JMG1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edf1Q9JMG1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edf1Q9JMG1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edf1Q9JMG1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Edf1Q9JMG1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Edf1Q9JMG1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms