Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apol9aQ8VDU3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apol9aQ8VDU3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms