Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NipblQ6KCD5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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