Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Knl1Q66JQ7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Knl1Q66JQ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms