Protein–RNA interactions for Protein: Q61712

Dnajc1, DnaJ homolog subfamily C member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc1Q61712 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc1Q61712 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajc1Q61712 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms