Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-37■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.465e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.245e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-214ENST00000605649 776 ntTSL 516.44■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-203ENST00000603393 1214 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.225e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.065e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-213ENST00000605197 760 ntTSL 212.57□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-212ENST00000604879 808 ntTSL 512.57□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 57.29□□□□□ -1.245e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HDLBP-247ENST00000498595 595 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.432e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.492e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HDLBP-236ENST00000477477 340 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.232e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-202ENST00000578069 456 ntTSL 25.25□□□□□ -1.572e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-205ENST00000582485 443 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-211ENST00000584441 328 ntTSL 35.08□□□□□ -1.62e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.712e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.812e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL26-212ENST00000584906 561 ntTSL 33.74□□□□□ -1.812e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.188e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)12.93□□□□□ -0.348e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.468e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.488e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.518e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.718e-8■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 THOC2-215ENST00000464992 902 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-205ENST00000567729 503 ntTSL 320.99■□□□□ 0.952e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-206ENST00000568016 432 ntTSL 519.76■□□□□ 0.752e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-204ENST00000566748 710 ntTSL 319.07■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-202ENST00000563100 723 ntTSL 512.73□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-203ENST00000563504 617 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-207ENST00000569021 392 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 MPHOSPH6-208ENST00000569599 619 ntTSL 29.64□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AIMP1-201ENST00000358008 2412 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -12e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 WDR75-203ENST00000436347 2703 ntTSL 27.27□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.252e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 WDR75-202ENST00000427960 4297 ntTSL 1 (best)3.89□□□□□ -1.792e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AIMP1-204ENST00000510207 568 ntTSL 43.61□□□□□ -1.832e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.438e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.058e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.018e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.438e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-208ENST00000409718 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.638e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.648e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-219ENST00000453663 637 ntTSL 410.02□□□□□ -0.818e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-206ENST00000409385 2320 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.978e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.178e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-207ENST00000409397 920 ntTSL 37.54□□□□□ -1.28e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.228e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-217ENST00000449647 678 ntTSL 56.44□□□□□ -1.388e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SPATS2L-213ENST00000438761 887 ntTSL 56.31□□□□□ -1.48e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.567e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.416e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HELZ-210ENST00000581159 617 ntTSL 315.79■□□□□ 0.126e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.026e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.127e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.26e-7■□□□□ 9.4
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TRA2AQ13595 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.466e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.587e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HELZ-212ENST00000584641 1101 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.636e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 511□□□□□ -0.656e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.727e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SF3B2-216ENST00000534765 3932 ntTSL 28.15□□□□□ -1.12e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.246e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RIOK3-205ENST00000581302 3049 ntTSL 27.23□□□□□ -1.257e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HELZ-202ENST00000417253 1872 ntTSL 56.99□□□□□ -1.296e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.326e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HELZ-208ENST00000580662 758 ntTSL 36.64□□□□□ -1.356e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RIOK3-206ENST00000581339 888 ntTSL 26.29□□□□□ -1.47e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.466e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RIOK3-209ENST00000584130 591 ntTSL 43.98□□□□□ -1.777e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HELZ-205ENST00000579861 583 ntTSL 33.88□□□□□ -1.796e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RIOK3-211ENST00000584992 396 ntTSL 33.39□□□□□ -1.877e-9■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 HELZ-209ENST00000580963 520 ntTSL 32.57□□□□□ -26e-7■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 RPL23A-209ENST00000582736 595 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.069e-73■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.439e-73■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-201ENST00000321233 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-212ENST00000580759 572 ntTSL 510.09□□□□□ -0.792e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-210ENST00000579634 580 ntTSL 39.62□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-214ENST00000582165 592 ntTSL 58.6□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-202ENST00000342555 1905 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-204ENST00000394673 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-206ENST00000577324 1005 ntTSL 24.91□□□□□ -1.622e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.82e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ZNF207-205ENST00000394679 847 ntTSL 32.86□□□□□ -1.952e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 AC005899.4-202ENST00000578389 429 ntTSL 22.72□□□□□ -1.972e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 NOP56-209ENST00000469588 950 ntTSL 220.57■□□□□ 0.884e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 9.4
TRA2AQ13595 ING5-206ENST00000482774 2376 ntTSL 315.53■□□□□ 0.084e-6■□□□□ 9.4
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