Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 SLM1YIL105C 2061 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 CSF1YLR087C 8877 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 SSD1YDR293C 3753 nt2.31□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 IRC8YJL051W 2469 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YOR170WYOR170W 306 nt2.3□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 TOR2YKL203C 7425 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 GYP5YPL249C 2685 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 MNE1YOR350C 1992 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 LYS14YDR034C 2373 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 TOF1YNL273W 3717 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 IRR1YIL026C 3453 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 DNF1YER166W 4716 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 ZRG8YER033C 3231 nt2.29□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YCR043CYCR043C 384 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 RPS17AYML024W 411 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YOR376WYOR376W 369 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 YKU70YMR284W 1809 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 SPC98YNL126W 2541 nt2.28□□□□□ -2.04
ATG11Q12527 VPS8YAL002W 3825 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.27□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 GIP3YPL137C 3831 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YNL170WYNL170W 396 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 SGF11YPL047W 300 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 RAV1YJR033C 4074 nt2.26□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 KIP1YBL063W 3336 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 NIP100YPL174C 2607 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 INO80YGL150C 4470 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 ANS1YHR126C 480 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 STH1YIL126W 4080 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 BPH1YCR032W 6504 nt2.25□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 SAP185YJL098W 3177 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 SRP14YDL092W 441 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 RPS27BYHR021C 249 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YMR045CYMR045C 5268 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 SLY1YDR189W 2001 nt2.24□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 TRL1YJL087C 2484 nt2.23□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 TIM9YEL020W-A 264 nt2.23□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 SPO75YLL005C 2607 nt2.22□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YOR218CYOR218C 420 nt2.22□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 snR52snR52 92 nt2.22□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 YPR097WYPR097W 3222 nt2.22□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 KOG1YHR186C 4674 nt2.22□□□□□ -2.05
ATG11Q12527 RTT107YHR154W 3213 nt2.21□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YBL012CYBL012C 402 nt2.21□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.21□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 ZRG17YNR039C 1818 nt2.19□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 SPO21YOL091W 1830 nt2.19□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 snR46snR46 197 nt2.19□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 USO1YDL058W 5373 nt2.19□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 NOP14YDL148C 2433 nt2.19□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 CAT2YML042W 2013 nt2.18□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 UFD4YKL010C 4452 nt2.18□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YFR016CYFR016C 3702 nt2.18□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.18□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 CDC60YPL160W 3273 nt2.18□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 MSC6YOR354C 2079 nt2.18□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 ULI1YFR026C 510 nt2.17□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 BRE1YDL074C 2103 nt2.17□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 RLM1YPL089C 2031 nt2.17□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YDR341CYDR341C 1824 nt2.17□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 RPL34BYIL052C 366 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 UBP2YOR124C 3819 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 YOR345CYOR345C 351 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 MCM10YIL150C 1716 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 SPP41YDR464W 4308 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 HSH155YMR288W 2916 nt2.16□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 LRE1YCL051W 1752 nt2.15□□□□□ -2.06
ATG11Q12527 RTT101YJL047C 2529 nt2.15□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 SDH6YDR379C-A 240 nt2.15□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 ECM12YHR021W-A 456 nt2.15□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 COF1YLL050C 432 nt2.15□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 DGR1YNL130C-A 147 nt2.15□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 TFC8YPL007C 1767 nt2.15□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 SIR4YDR227W 4077 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 YJL120WYJL120W 324 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 RPS25BYLR333C 327 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 SYH1YPL105C 2550 nt2.14□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 RGA1YOR127W 3024 nt2.13□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 RPL31AYDL075W 342 nt2.13□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 Q0143Q0143 153 nt2.13□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 YBR174CYBR174C 315 nt2.13□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 FKS1YLR342W 5631 nt2.13□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 ZIP1YDR285W 2628 nt2.13□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 ZIP2YGL249W 2115 nt2.12□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 NAM7YMR080C 2916 nt2.12□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 RPL37BYDR500C 267 nt2.12□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 ENV11YGR071C 2583 nt2.12□□□□□ -2.07
ATG11Q12527 RAD34YDR314C 2079 nt2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.4 ms