Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeast

Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY2B-B	Q12491	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	YBR223W-A	YBR223W-A	120 nt		-0.57	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	VPS28	YPL065W	729 nt		-0.59	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	YPL044C	YPL044C	549 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	ERV15	YBR210W	429 nt		-0.6	□□□□□ -2.5
TY2B-B	Q12491	HTB1	YDR224C	396 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	RPS26A	YGL189C	360 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	RFA3	YJL173C	369 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	ARV1	YLR242C	966 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	ATP15	YPL271W	189 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YKU70	YMR284W	1809 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YDR182W-A	YDR182W-A	204 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YER038W-A	YER038W-A	381 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	CDC33	YOL139C	642 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YDL068W	YDL068W	330 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	COX8	YLR395C	237 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	GOS1	YHL031C	672 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YKL115C	YKL115C	393 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YPL185W	YPL185W	396 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	BI3	Q0115	1554 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	TDA2	YER071C	381 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	NUP82	YJL061W	2142 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YAL067W-A	YAL067W-A	228 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	SMD2	YLR275W	333 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	NIP1	YMR309C	2439 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	YDR344C	YDR344C	444 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
TY2B-B	Q12491	snR33	snR33	183 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	OST4	YDL232W	111 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YGL204C	YGL204C	306 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YDL152W	YDL152W	366 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	RPS7B	YNL096C	573 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YPR142C	YPR142C	564 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	NFU1	YKL040C	771 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	MFA2	YNL145W	117 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YNL146W	YNL146W	303 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YJL120W	YJL120W	324 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	GIM5	YML094W	492 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YPL205C	YPL205C	345 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	snR44	snR44	211 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	ASE1	YOR058C	2658 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YER158W-A	YER158W-A	216 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YLR399W-A	YLR399W-A	105 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	BI4	Q0120	1917 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YOL118C	YOL118C	309 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
TY2B-B	Q12491	YLL032C	YLL032C	2478 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	MMS21	YEL019C	804 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	RPL29	YFR032C-A	180 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YBR064W	YBR064W	429 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YJL086C	YJL086C	369 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	CMS1	YLR003C	876 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	GSP1	YLR293C	660 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	LSO2	YGR169C-A	279 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YKL023C-A	YKL023C-A	228 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	COY1	YKL179C	2040 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	RUB1	YDR139C	234 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	TFB6	YOR352W	1032 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	SUS1	YBR111W-A	291 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YFR057W	YFR057W	456 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YLR271W	YLR271W	825 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YBR121C-A	YBR121C-A	159 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YDR008C	YDR008C	351 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	RSM18	YER050C	417 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YJR079W	YJR079W	330 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	MRPS8	YMR158W	468 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YPR099C	YPR099C	357 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	ATP20	YPR020W	348 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YGL042C	YGL042C	306 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YMR153C-A	YMR153C-A	336 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
TY2B-B	Q12491	BLS1	YLR408C	369 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	PAA1	YDR071C	576 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	RMD6	YEL072W	696 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	THG1	YGR024C	714 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	YOR248W	YOR248W	303 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	COG6	YNL041C	2520 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	GRX5	YPL059W	453 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	ATC1	YDR184C	885 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	YGR115C	YGR115C	780 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	MRPL31	YKL138C	396 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	UBS1	YBR165W	834 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	YPR096C	YPR096C	303 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	snR36	snR36	182 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	ZIP2	YGL249W	2115 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	SEM1	YDR363W-A	270 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	DIE2	YGR227W	1578 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	RSM23	YGL129C	1353 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	YDR290W	YDR290W	330 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	snR79	snR79	84 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	PAN3	YKL025C	2040 nt		-0.84	□□□□□ -2.54
TY2B-B	Q12491	LSM4	YER112W	564 nt		-0.85	□□□□□ -2.55

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