Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 IRC2YDR112W 309 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 MMS21YEL019C 804 nt-0.24□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 snR79snR79 84 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 DFG10YIL049W 762 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YKL136WYKL136W 399 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YNL150WYNL150W 408 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 BI4Q0120 1917 nt-0.25□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 RAD34YDR314C 2079 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YDR008CYDR008C 351 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 SBH2YER019C-A 267 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 AFB1YLR040C 675 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 INP2YMR163C 2118 nt-0.26□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 RPS27AYKL156W 249 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 BSC3YLR465C 309 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YNL211CYNL211C 261 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 CSM4YPL200W 471 nt-0.27□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 CUL3YGR003W 2235 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 snR59snR59 78 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 DAD1YDR016C 285 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YDR029WYDR029W 315 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 RMD6YEL072W 696 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 TDA2YER071C 381 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 BLS1YLR408C 369 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YBR064WYBR064W 429 nt-0.28□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YNL050CYNL050C 813 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 RPS7BYNL096C 573 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YPL044CYPL044C 549 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YLR271WYLR271W 825 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 SPC24YMR117C 642 nt-0.29□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 GPX1YKL026C 504 nt-0.3□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 PSF2YJL072C 642 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 CDC33YOL139C 642 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 ORC3YLL004W 1851 nt-0.31□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 RUB1YDR139C 234 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YPL225WYPL225W 441 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.32□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 PAN3YKL025C 2040 nt-0.33□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 COX5BYIL111W 456 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YJR079WYJR079W 330 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 SOV1YMR066W 2697 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 NPC2YDL046W 522 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 snR8snR8 190 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 LIN1YHR156C 1023 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YOL106WYOL106W 354 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YPL185WYPL185W 396 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YBR071WYBR071W 636 nt-0.34□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 ASE1YOR058C 2658 nt-0.35□□□□□ -2.46
TY1B-BLQ12490 YDL187CYDL187C 330 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 MAM33YIL070C 801 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 TFB6YOR352W 1032 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 snR44snR44 211 nt-0.35□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 OLI1Q0130 231 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 EFR3YMR212C 2349 nt-0.36□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 GIM5YML094W 492 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 RFX1YLR176C 2436 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YDR344CYDR344C 444 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YLR101CYLR101C 396 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YOL160WYOL160W 342 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.37□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 COX7YMR256C 183 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.38□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 MRPL31YKL138C 396 nt-0.39□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.39□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.39□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YJR011CYJR011C 786 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YPL197CYPL197C 414 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YHR054CYHR054C 1065 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 HTB2YBL002W 396 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.4□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 RAD61YDR014W 1944 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YDR210WYDR210W 228 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YER188C-AYER188C-A 300 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YJL135WYJL135W 318 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-0.41□□□□□ -2.47
TY1B-BLQ12490 NIP1YMR309C 2439 nt-0.41□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YFR057WYFR057W 456 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 RPM2YML091C 3609 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 RSM23YGL129C 1353 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 SEC10YLR166C 2616 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 ATC1YDR184C 885 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 QCR7YDR529C 384 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 RPS26AYGL189C 360 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 LRP1YHR081W 555 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 RPS30AYLR287C-A 192 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YOR248WYOR248W 303 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 snR34snR34 203 nt-0.42□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 SDS22YKL193C 1017 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 ECM9YKR004C 1134 nt-0.43□□□□□ -2.48
TY1B-BLQ12490 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.43□□□□□ -2.48
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