Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OCA6	Q12454	NPC2	YDL046W	522 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	TIM10	YHR005C-A	282 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	MRPL31	YKL138C	396 nt		-0.01	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YDR344C	YDR344C	444 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YKL111C	YKL111C	336 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	COX12	YLR038C	252 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	RPL26A	YLR344W	384 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YMR013C-A	YMR013C-A	150 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	CSM4	YPL200W	471 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	snR45	snR45	172 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	FYV10	YIL097W	1551 nt		-0.02	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	PET111	YMR257C	2403 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YER076W-A	YER076W-A	348 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	BIG1	YHR101C	1008 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	LIN1	YHR156C	1023 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	YNL150W	YNL150W	408 nt		-0.03	□□□□□ -2.41
OCA6	Q12454	PKH2	YOL100W	3246 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	YDR220C	YDR220C	294 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	VMA21	YGR105W	234 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	YLR146W-A	YLR146W-A	189 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	BSC3	YLR465C	309 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	YOR053W	YOR053W	342 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	RCN2	YOR220W	798 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	TFB6	YOR352W	1032 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	PRP5	YBR237W	2550 nt		-0.04	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	MLP1	YKR095W	5628 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	POL32	YJR043C	1053 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	RFX1	YLR176C	2436 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	VIK1	YPL253C	1944 nt		-0.05	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	GPG1	YGL121C	381 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	CUP1-1	YHR053C	186 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	CUP1-2	YHR055C	186 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	IPI3	YNL182C	1668 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	THO2	YNL139C	4794 nt		-0.06	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		-0.07	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	BI4	Q0120	1917 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	YJR079W	YJR079W	330 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	CDC33	YOL139C	642 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	snR190	snR190	190 nt		-0.08	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	CMC1	YKL137W	336 nt		-0.09	□□□□□ -2.42
OCA6	Q12454	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	SDS22	YKL193C	1017 nt		-0.1	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	ASE1	YOR058C	2658 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YLR232W	YLR232W	348 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YLR271W	YLR271W	825 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	MRPL50	YNR022C	420 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YPL044C	YPL044C	549 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	SVS1	YPL163C	783 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	ZIP2	YGL249W	2115 nt		-0.11	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YGL015C	YGL015C	393 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	CWC23	YGL128C	852 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YLR217W	YLR217W	324 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YPR096C	YPR096C	303 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YCL002C	YCL002C	792 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	UTP8	YGR128C	2142 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	INP2	YMR163C	2118 nt		-0.13	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	COG8	YML071C	1824 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YJL135W	YJL135W	318 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	VAM3	YOR106W	852 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YOR248W	YOR248W	303 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	MCM10	YIL150C	1716 nt		-0.14	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	RPL35A	YDL191W	363 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YDR269C	YDR269C	324 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	RPS27A	YKL156W	249 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	RPB10	YOR210W	213 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	YBR064W	YBR064W	429 nt		-0.15	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	PRP42	YDR235W	1635 nt		-0.16	□□□□□ -2.43
OCA6	Q12454	BUD26	YDR241W	288 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YBL062W	YBL062W	381 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YNL050C	YNL050C	813 nt		-0.16	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	OST4	YDL232W	111 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	SSS1	YDR086C	243 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	ULI1	YFR026C	510 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YLR198C	YLR198C	360 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YAR053W	YAR053W	297 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YLR412C-A	YLR412C-A	207 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YMR141W-A	YMR141W-A	225 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YMR290W-A	YMR290W-A	348 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	IRC16	YPR038W	360 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.17	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	RSM23	YGL129C	1353 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	HAL9	YOL089C	3093 nt		-0.18	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YFR012W-A	YFR012W-A	87 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	OLI1	Q0130	231 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	PRP21	YJL203W	843 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YPL185W	YPL185W	396 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YBR076C-A	YBR076C-A	267 nt		-0.19	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	snR5	snR5	204 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YGR228W	YGR228W	345 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YBL008W-A	YBL008W-A	240 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YPR160W-A	YPR160W-A	81 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.2	□□□□□ -2.44
OCA6	Q12454	YDR029W	YDR029W	315 nt		-0.21	□□□□□ -2.44

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