Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YLL054CYLL054C 2532 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 HMRA1YCR097W 381 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YPR012WYPR012W 255 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YSY6YBR162W-A 198 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 RFX1YLR176C 2436 nt1.18□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 VPS54YDR027C 2670 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YCS4YLR272C 3531 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YDL211CYDL211C 1119 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 PAU2YEL049W 363 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 UPS1YLR193C 528 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 PAC1YOR269W 1485 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 MSH3YCR092C 3057 nt1.17□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 SLX4YLR135W 2247 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YGL217CYGL217C 342 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 IRC23YOR044W 474 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YPL261CYPL261C 309 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YPR063CYPR063C 423 nt1.16□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YLL032CYLL032C 2478 nt1.15□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 MRPL31YKL138C 396 nt1.15□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 RAD9YDR217C 3930 nt1.15□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 SEC3YER008C 4011 nt1.15□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 snR56snR56 88 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 RPB10YOR210W 213 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 RPL33BYOR234C 324 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 NUT2YPR168W 474 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 CLU1YMR012W 3834 nt1.14□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 SLY1YDR189W 2001 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YJR003CYJR003C 1560 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 SPC98YNL126W 2541 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 TTI1YKL033W 3117 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YJL135WYJL135W 318 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YAR053WYAR053W 297 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 snR51snR51 107 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 NUP188YML103C 4968 nt1.13□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 TRM732YMR259C 4263 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 CDC36YDL165W 576 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YGR035CYGR035C 351 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YOR029WYOR029W 336 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YBR012CYBR012C 420 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 PIG1YLR273C 1947 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 NOC3YLR002C 1992 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 PBY1YBR094W 2262 nt1.12□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 SAS3YBL052C 2496 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 NUT1YGL151W 3399 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 snR72snR72 98 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 GIM4YEL003W 336 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YLL020CYLL020C 306 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 SWI4YER111C 3282 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 AHC1YOR023C 1701 nt1.11□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 YNL058CYNL058C 951 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 ENV11YGR071C 2583 nt1.1□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 CSN9YDR179C 489 nt1.09□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 SDH2YLL041C 801 nt1.09□□□□□ -2.23
PRP46Q12417 MDS3YGL197W 4464 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 MAD1YGL086W 2250 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 SPT21YMR179W 2277 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 PIP2YOR363C 2991 nt1.08□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 APL2YKL135C 2181 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 RPS20YHL015W 366 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YOR199WYOR199W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 BIL1YOR304C-A 231 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 snR14snR14 160 nt1.07□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 ZIP2YGL249W 2115 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YDR426CYDR426C 378 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YPR197CYPR197C 564 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 SIP4YJL089W 2490 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 INP2YMR163C 2118 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 NUP145YGL092W 3954 nt1.06□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 SCW11YGL028C 1629 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 ATP6Q0085 780 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 IML1YJR138W 4755 nt1.05□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 AIM44YPL158C 2277 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 NST1YNL091W 3723 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 NPC2YDL046W 522 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 RPL38YLR325C 237 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 MPT5YGL178W 2580 nt1.04□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 APL3YBL037W 3078 nt1.03□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 RPL35AYDL191W 363 nt1.03□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 YOL160WYOL160W 342 nt1.03□□□□□ -2.24
PRP46Q12417 EAF1YDR359C 2949 nt1.03□□□□□ -2.24
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