Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 SDH2YLL041C 801 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 UPS1YLR193C 528 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 MRPL50YNR022C 420 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YJR029WYJR029W 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.02□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 NUP145YGL092W 3954 nt1.01□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YKL202WYKL202W 582 nt1.01□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 HCH1YNL281W 462 nt1.01□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YBR012CYBR012C 420 nt1.01□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SCW11YGL028C 1629 nt1□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 MPT5YGL178W 2580 nt1□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 RPS27AYKL156W 249 nt1□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SET3YKR029C 2256 nt1□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SEC3YER008C 4011 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SAS3YBL052C 2496 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 EFR3YMR212C 2349 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 VAM6YDL077C 3150 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 Q0017Q0017 162 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SLY1YDR189W 2001 nt0.99□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SLD3YGL113W 2007 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 RPL34BYIL052C 366 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YLR456WYLR456W 615 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.98□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 AIM9YER080W 1884 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 NUP157YER105C 4176 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 SDH7YDR511W 402 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 RRT1YBL048W 312 nt0.97□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YPR117WYPR117W 7470 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 PRP16YKR086W 3216 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YJL007CYJL007C 315 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 UBP3YER151C 2739 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 LCD1YDR499W 2244 nt0.96□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 NPC2YDL046W 522 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YAP6YDR259C 1152 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 RPS24BYIL069C 408 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 BEM2YER155C 6504 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YJR003CYJR003C 1560 nt0.95□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YDL073WYDL073W 2955 nt0.94□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 ZIP2YGL249W 2115 nt0.94□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YJL135WYJL135W 318 nt0.94□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 RPL26AYLR344W 384 nt0.94□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YPL229WYPL229W 621 nt0.94□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 STO1YMR125W 2586 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YOL160WYOL160W 342 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YOR199WYOR199W 330 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YPL261CYPL261C 309 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 SLI15YBR156C 2097 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 BUD3YCL014W 4911 nt0.93□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 ISF1YMR081C 1017 nt0.92□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 KAP120YPL125W 3099 nt0.92□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 PDE2YOR360C 1581 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 COG4YPR105C 2586 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 snR72snR72 98 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YLR202CYLR202C 327 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 snR51snR51 107 nt0.91□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 PAN2YGL094C 3348 nt0.9□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 MMS4YBR098W 2076 nt0.9□□□□□ -2.26
RRP42Q12277 YAR047CYAR047C 321 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 IRC23YOR044W 474 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 IFH1YLR223C 3258 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 FIG4YNL325C 2640 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 SCC2YDR180W 4482 nt0.9□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 AIM44YPL158C 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YHL041WYHL041W 450 nt0.89□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YKL083WYKL083W 615 nt0.89□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YPL185WYPL185W 396 nt0.89□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 NIP100YPL174C 2607 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YLR434CYLR434C 384 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 RPB10YOR210W 213 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YPL205CYPL205C 345 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 RAD34YDR314C 2079 nt0.88□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 PCF11YDR228C 1881 nt0.87□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YGR042WYGR042W 816 nt0.87□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 ATG31YDR022C 591 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YHL042WYHL042W 453 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YKL063CYKL063C 504 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 PRM3YPL192C 402 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 PAU24YBR301W 363 nt0.86□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 INP2YMR163C 2118 nt0.85□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YDL206WYDL206W 2289 nt0.85□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 YPL068CYPL068C 882 nt0.84□□□□□ -2.27
RRP42Q12277 SMC1YFL008W 3678 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 YDL196WYDL196W 330 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 RPS20YHL015W 366 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 PAM16YJL104W 450 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 YNL058CYNL058C 951 nt0.83□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 YER079WYER079W 633 nt0.82□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 GPG1YGL121C 381 nt0.82□□□□□ -2.28
RRP42Q12277 STF2YGR008C 255 nt0.82□□□□□ -2.28
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