Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 GIP3YPL137C 3831 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 ENV11YGR071C 2583 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 NAM7YMR080C 2916 nt2.58□□□□□ -2
MCD1Q12158 ZIP2YGL249W 2115 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 TRL1YJL087C 2484 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 ECM12YHR021W-A 456 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 YJL120WYJL120W 324 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 YBR174CYBR174C 315 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 DCP2YNL118C 2913 nt2.57□□□□□ -2
MCD1Q12158 CAT2YML042W 2013 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 RAD34YDR314C 2079 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 ATP7YKL016C 525 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 RPS25BYLR333C 327 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 YNL170WYNL170W 396 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 YDR341CYDR341C 1824 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 SAS3YBL052C 2496 nt2.56□□□□□ -2
MCD1Q12158 ULI1YFR026C 510 nt2.55□□□□□ -2
MCD1Q12158 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.55□□□□□ -2
MCD1Q12158 PDR1YGL013C 3207 nt2.54□□□□□ -2
MCD1Q12158 MAK10YEL053C 2202 nt2.54□□□□□ -2
MCD1Q12158 ELG1YOR144C 2376 nt2.53□□□□□ -2
MCD1Q12158 BRP1YGL007W 378 nt2.53□□□□□ -2
MCD1Q12158 snR52snR52 92 nt2.53□□□□□ -2
MCD1Q12158 MAD1YGL086W 2250 nt2.53□□□□□ -2
MCD1Q12158 CHC1YGL206C 4962 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 NOC3YLR002C 1992 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 RTT107YHR154W 3213 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 SEC16YPL085W 6588 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 APL2YKL135C 2181 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 MSH5YDL154W 2706 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 SYH1YPL105C 2550 nt2.52□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 CDC60YPL160W 3273 nt2.51□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.51□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.51□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 NUP170YBL079W 4509 nt2.5□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 TIM9YEL020W-A 264 nt2.5□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 COF1YLL050C 432 nt2.5□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.49□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 LRE1YCL051W 1752 nt2.49□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 RPL31AYDL075W 342 nt2.49□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 RPL37BYDR500C 267 nt2.49□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 PDR11YIL013C 4236 nt2.49□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 MLH3YPL164C 2148 nt2.48□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 NEW1YPL226W 3591 nt2.48□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 UBP1YDL122W 2430 nt2.48□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 YFR016CYFR016C 3702 nt2.48□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 SDH6YDR379C-A 240 nt2.47□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 KTI11YBL071W-A 249 nt2.47□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 YOR345CYOR345C 351 nt2.47□□□□□ -2.01
MCD1Q12158 TOR1YJR066W 7413 nt2.46□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 PAU3YCR104W 375 nt2.46□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 VTC1YER072W 390 nt2.46□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.46□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 VPS13YLL040C 9435 nt2.45□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YIR044CYIR044C 186 nt2.45□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt2.45□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 PET309YLR067C 2898 nt2.45□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YPR097WYPR097W 3222 nt2.45□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 PIG1YLR273C 1947 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 ARP8YOR141C 2646 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 PHO91YNR013C 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YLL007CYLL007C 1998 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 CTR9YOL145C 3234 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 RTT101YJL047C 2529 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 AGC1YPR021C 2709 nt2.44□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 SLN1YIL147C 3663 nt2.43□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 DGR2YKL121W 2559 nt2.43□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.43□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.43□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 RPL33BYOR234C 324 nt2.43□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 SCD5YOR329C 2619 nt2.43□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 UBP15YMR304W 3693 nt2.42□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 HMI1YOL095C 2121 nt2.42□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 MLH1YMR167W 2310 nt2.41□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 CUL3YGR003W 2235 nt2.41□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YDL196WYDL196W 330 nt2.41□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.41□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 PTP2YOR208W 2253 nt2.41□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 IRA2YOL081W 9240 nt2.41□□□□□ -2.02
MCD1Q12158 YGR164WYGR164W 336 nt2.4□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.4□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 SSD1YDR293C 3753 nt2.4□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 NCA2YPR155C 1851 nt2.39□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 BUD2YKL092C 3315 nt2.39□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 PMP1YCR024C-A 123 nt2.39□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.39□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 AHC1YOR023C 1701 nt2.39□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 BNI1YNL271C 5862 nt2.39□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 TOF1YNL273W 3717 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 CSF1YLR087C 8877 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 HIR3YJR140C 4947 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 IRE1YHR079C 3348 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YEL073CYEL073C 324 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 Q0143Q0143 153 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YHR210CYHR210C 1026 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 YOR055WYOR055W 435 nt2.38□□□□□ -2.03
MCD1Q12158 IST2YBR086C 2841 nt2.38□□□□□ -2.03
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