Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 YER181CYER181C 324 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 ANS1YHR126C 480 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 SKI3YPR189W 4299 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 INP2YMR163C 2118 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 PEP1YBL017C 4740 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 ENV11YGR071C 2583 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 snR72snR72 98 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 YFL063WYFL063W 456 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 PCC1YKR095W-A 267 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 VPS15YBR097W 4365 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 CTF4YPR135W 2784 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 YHR210CYHR210C 1026 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 YJL135WYJL135W 318 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 APL2YKL135C 2181 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 snR65snR65 100 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 NPC2YDL046W 522 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 YGL149WYGL149W 306 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 EMC5YIL027C 426 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP6Q12149 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.84□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 IRC20YLR247C 4671 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YAR029WYAR029W 225 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 PMD1YER132C 5262 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 ZIP2YGL249W 2115 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 SDH2YLL041C 801 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 DBP6YNR038W 1890 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 SEC5YDR166C 2916 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YOR019WYOR019W 2193 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 COF1YLL050C 432 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 SPO24YPR036W-A 204 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 RAD50YNL250W 3939 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 CFT1YDR301W 4074 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 KCS1YDR017C 3153 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YOL160WYOL160W 342 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 NOC3YLR002C 1992 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 UFD2YDL190C 2886 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YLR419WYLR419W 4308 nt1.79□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 HTL1YCR020W-B 237 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YIL102CYIL102C 306 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 YJL022WYJL022W 309 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 SMC4YLR086W 4257 nt1.78□□□□□ -2.12
RRP6Q12149 ALK1YGL021W 2283 nt1.78□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 NCA2YPR155C 1851 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YOR376WYOR376W 369 nt1.77□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YGL217CYGL217C 342 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 MAD1YGL086W 2250 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 NUP192YJL039C 5052 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.76□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 BST1YFL025C 3090 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YCR022CYCR022C 345 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YLR140WYLR140W 327 nt1.75□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YIL032CYIL032C 357 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.74□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 NUT1YGL151W 3399 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 VPS55YJR044C 423 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 COA6YMR244C-A 315 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 SCW11YGL028C 1629 nt1.73□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 SLX4YLR135W 2247 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 KAP122YGL016W 3246 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 RAD34YDR314C 2079 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YOR282WYOR282W 321 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 YPR063CYPR063C 423 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 NIP100YPL174C 2607 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 VPS54YDR027C 2670 nt1.72□□□□□ -2.13
RRP6Q12149 snR60snR60 104 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 YLL054CYLL054C 2532 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 SPC98YNL126W 2541 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 SXM1YDR395W 2835 nt1.71□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 SLI15YBR156C 2097 nt1.7□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 BRR2YER172C 6492 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 YDR344CYDR344C 444 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 YGR069WYGR069W 336 nt1.69□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 SPT21YMR179W 2277 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 TRM3YDL112W 4311 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 YDL211CYDL211C 1119 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 SSS1YDR086C 243 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 YHL042WYHL042W 453 nt1.68□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 ADR1YDR216W 3972 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 OST1YJL002C 1431 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 YIR044CYIR044C 186 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 MEC1YBR136W 7107 nt1.67□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 COG4YPR105C 2586 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 ALG13YGL047W 609 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 SBE22YHR103W 2559 nt1.66□□□□□ -2.14
RRP6Q12149 snR14snR14 160 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YBR174CYBR174C 315 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 RAD61YDR014W 1944 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 COG8YML071C 1824 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.65□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 LCD1YDR499W 2244 nt1.64□□□□□ -2.15
RRP6Q12149 YCK3YER123W 1575 nt1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.2 ms