Protein–RNA interactions for Protein: Q12006

PFA4, Palmitoyltransferase PFA4, yeastyeast

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PFA4Q12006 TRL1YJL087C 2484 nt1.88□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 DCP2YNL118C 2913 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 RGA1YOR127W 3024 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YLR294CYLR294C 330 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 FKS1YLR342W 5631 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YOL160WYOL160W 342 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YOR302WYOR302W 78 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 CDC60YPL160W 3273 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 VPS54YDR027C 2670 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 SPP41YDR464W 4308 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YDR341CYDR341C 1824 nt1.87□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 ZIP1YDR285W 2628 nt1.86□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.86□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 VPS55YJR044C 423 nt1.86□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 RTT107YHR154W 3213 nt1.86□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 MAK10YEL053C 2202 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 SRP14YDL092W 441 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YJL182CYJL182C 318 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 RRT15YLR162W-A 189 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YBL012CYBL012C 402 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 MPT5YGL178W 2580 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 ELG1YOR144C 2376 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 GIP3YPL137C 3831 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 NOP14YDL148C 2433 nt1.85□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 SEC31YDL195W 3822 nt1.84□□□□□ -2.11
PFA4Q12006 YPR097WYPR097W 3222 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 REV3YPL167C 4515 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 SYH1YPL105C 2550 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 PET309YLR067C 2898 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 RTT101YJL047C 2529 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 SPC98YNL126W 2541 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 NAM7YMR080C 2916 nt1.83□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 SAS3YBL052C 2496 nt1.82□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 RPS27BYHR021C 249 nt1.82□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.82□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YOR218CYOR218C 420 nt1.82□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YPR092WYPR092W 306 nt1.82□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.82□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 PEP1YBL017C 4740 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 UBP2YOR124C 3819 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 RPL37BYDR500C 267 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 SEC5YDR166C 2916 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 MSC6YOR354C 2079 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 ZIP2YGL249W 2115 nt1.81□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 HSH155YMR288W 2916 nt1.8□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 NEO1YIL048W 3456 nt1.8□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YEL014CYEL014C 306 nt1.8□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 OLI1Q0130 231 nt1.8□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 TOR2YKL203C 7425 nt1.8□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 USO1YDL058W 5373 nt1.79□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YGR151CYGR151C 336 nt1.79□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 MLH3YPL164C 2148 nt1.79□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 MSH5YDL154W 2706 nt1.79□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 CTR9YOL145C 3234 nt1.79□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 SPO75YLL005C 2607 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 ENV11YGR071C 2583 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 RLM1YPL089C 2031 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 RPL34BYIL052C 366 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 KIP1YBL063W 3336 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 IST2YBR086C 2841 nt1.78□□□□□ -2.12
PFA4Q12006 HMI1YOL095C 2121 nt1.78□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 RAD34YDR314C 2079 nt1.78□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YKU70YMR284W 1809 nt1.77□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 MCM10YIL150C 1716 nt1.77□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 APL2YKL135C 2181 nt1.77□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YDL118WYDL118W 381 nt1.77□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.77□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 IRE1YHR079C 3348 nt1.76□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YOR376WYOR376W 369 nt1.76□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 SGF11YPL047W 300 nt1.76□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 MAD1YGL086W 2250 nt1.76□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 BUD2YKL092C 3315 nt1.76□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 CHC1YGL206C 4962 nt1.75□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 AGC1YPR021C 2709 nt1.75□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 DGR2YKL121W 2559 nt1.75□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 TDA9YML081W 3756 nt1.75□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 snR74snR74 88 nt1.74□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YIR044CYIR044C 186 nt1.74□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 SIR4YDR227W 4077 nt1.74□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 CAT2YML042W 2013 nt1.74□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 NOC3YLR002C 1992 nt1.73□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.73□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YJL120WYJL120W 324 nt1.73□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 RPS25BYLR333C 327 nt1.73□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.73□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 SPO21YOL091W 1830 nt1.73□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 ANS1YHR126C 480 nt1.72□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 YBR174CYBR174C 315 nt1.72□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 FRK1YPL141C 2598 nt1.72□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 PIG1YLR273C 1947 nt1.72□□□□□ -2.13
PFA4Q12006 CUL3YGR003W 2235 nt1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43 ms