Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 EMC5YIL027C 426 nt1.65□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.65□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YNL058CYNL058C 951 nt1.65□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.65□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 SAS3YBL052C 2496 nt1.65□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 PIG1YLR273C 1947 nt1.64□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YAR053WYAR053W 297 nt1.64□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YAF9YNL107W 681 nt1.64□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 SPO24YPR036W-A 204 nt1.64□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YPR197CYPR197C 564 nt1.63□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 MDS3YGL197W 4464 nt1.63□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 CDC25YLR310C 4770 nt1.62□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.62□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 CSN9YDR179C 489 nt1.62□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YJL022WYJL022W 309 nt1.62□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 snR51snR51 107 nt1.62□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 ENV11YGR071C 2583 nt1.61□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 RPB10YOR210W 213 nt1.61□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 BIL1YOR304C-A 231 nt1.61□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 ALK1YGL021W 2283 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 SGO1YOR073W 1773 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 RPL40BYKR094C 387 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 COF1YLL050C 432 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 RPL38YLR325C 237 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 TIM18YOR297C 579 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 LAA1YJL207C 6045 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 NCA2YPR155C 1851 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 MVP1YMR004W 1536 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 BST1YFL025C 3090 nt1.6□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 OST1YJL002C 1431 nt1.59□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 SEC5YDR166C 2916 nt1.59□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.59□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.59□□□□□ -2.15
CTI6Q08923 UFD2YDL190C 2886 nt1.59□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 VPS55YJR044C 423 nt1.58□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 RPS30BYOR182C 192 nt1.58□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.58□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 RAD50YNL250W 3939 nt1.58□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 INP2YMR163C 2118 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 SDH2YLL041C 801 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YLR140WYLR140W 327 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 NOC3YLR002C 1992 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 RIM20YOR275C 1986 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 KAP122YGL016W 3246 nt1.57□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 ZIP2YGL249W 2115 nt1.56□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.56□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.56□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YOR199WYOR199W 330 nt1.56□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YOR376WYOR376W 369 nt1.56□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 IML1YJR138W 4755 nt1.56□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 SMC4YLR086W 4257 nt1.55□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 CCH1YGR217W 6120 nt1.55□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.55□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 FYV8YGR196C 2454 nt1.55□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 NUT1YGL151W 3399 nt1.55□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 snR72snR72 98 nt1.54□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 NHP2YDL208W 471 nt1.54□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YGL217CYGL217C 342 nt1.54□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YOL160WYOL160W 342 nt1.54□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.54□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.53□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.53□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YJL135WYJL135W 318 nt1.53□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 SLX4YLR135W 2247 nt1.53□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 AHC1YOR023C 1701 nt1.53□□□□□ -2.16
CTI6Q08923 YLL054CYLL054C 2532 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 VPS54YDR027C 2670 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 RPL35AYDL191W 363 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YDR102CYDR102C 333 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 QCR9YGR183C 201 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 INA22YIR024C 651 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YJL015CYJL015C 285 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 PCC1YKR095W-A 267 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 HKR1YDR420W 5409 nt1.52□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.51□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.51□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YCS4YLR272C 3531 nt1.51□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 MAD1YGL086W 2250 nt1.51□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 SCW11YGL028C 1629 nt1.51□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 FIG2YCR089W 4830 nt1.51□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 NPC2YDL046W 522 nt1.5□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YDR426CYDR426C 378 nt1.5□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YJR011CYJR011C 786 nt1.49□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.49□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.49□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 EST2YLR318W 2655 nt1.49□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 SPC110YDR356W 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.48□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YSY6YBR162W-A 198 nt1.48□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YER097WYER097W 330 nt1.47□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.47□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 HTB2YBL002W 396 nt1.47□□□□□ -2.17
CTI6Q08923 SIP4YJL089W 2490 nt1.46□□□□□ -2.18
CTI6Q08923 RAD34YDR314C 2079 nt1.46□□□□□ -2.18
CTI6Q08923 SLI15YBR156C 2097 nt1.46□□□□□ -2.18
CTI6Q08923 YDR413CYDR413C 576 nt1.46□□□□□ -2.18
CTI6Q08923 POL5YEL055C 3069 nt1.46□□□□□ -2.18
CTI6Q08923 AZF1YOR113W 2745 nt1.46□□□□□ -2.18
CTI6Q08923 SPC98YNL126W 2541 nt1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 74.6 ms