Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 YLL007CYLL007C 1998 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YLL032CYLL032C 2478 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YIL059CYIL059C 366 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 AFB1YLR040C 675 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 RRT1YBL048W 312 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 IRC16YPR038W 360 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 WAR1YML076C 2835 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 GEA2YEL022W 4380 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 DBP6YNR038W 1890 nt0.56□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.55□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YER135CYER135C 393 nt0.54□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 ECM12YHR021W-A 456 nt0.54□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.54□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YPR153WYPR153W 423 nt0.54□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.53□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 LTE1YAL024C 4308 nt0.53□□□□□ -2.32
ABP140Q08641 SLI15YBR156C 2097 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 MET32YDR253C 576 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 ISD11YER048W-A 285 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 MRPL31YKL138C 396 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 RPL32YBL092W 393 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YOL014WYOL014W 375 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 RFX1YLR176C 2436 nt0.52□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.51□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YGR042WYGR042W 816 nt0.51□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 PRP21YJL203W 843 nt0.51□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 ILM1YJR118C 612 nt0.51□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YOL029CYOL029C 606 nt0.51□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 WIP1YDR374W-A 270 nt0.5□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YPR039WYPR039W 336 nt0.5□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 PRP16YKR086W 3216 nt0.5□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 FMP27YLR454W 7887 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 NPC2YDL046W 522 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 HUR1YGL168W 333 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YIL029CYIL029C 429 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 ULP2YIL031W 3105 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YSP1YHR155W 3687 nt0.49□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YKL044WYKL044W 321 nt0.48□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.47□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 Q0255Q0255 1419 nt0.47□□□□□ -2.33
ABP140Q08641 YDL016CYDL016C 303 nt0.46□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YOR282WYOR282W 321 nt0.46□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 VMA21YGR105W 234 nt0.45□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YJR141WYJR141W 1044 nt0.45□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.45□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 RCN2YOR220W 798 nt0.45□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 BFR2YDR299W 1605 nt0.45□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 PAN2YGL094C 3348 nt0.44□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YDR269CYDR269C 324 nt0.44□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 RPL9AYGL147C 576 nt0.44□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 TRS65YGR166W 1683 nt0.43□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 SNU56YDR240C 1479 nt0.43□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 APQ13YJL075C 417 nt0.43□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 UBX4YMR067C 1251 nt0.43□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 ZIP2YGL249W 2115 nt0.43□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 GPG1YGL121C 381 nt0.42□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YGR025WYGR025W 303 nt0.42□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.42□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.41□□□□□ -2.34
ABP140Q08641 YGL239CYGL239C 315 nt0.4□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 BER1YLR412W 825 nt0.4□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 snR13snR13 124 nt0.4□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 PMP1YCR024C-A 123 nt0.39□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 SVS1YPL163C 783 nt0.39□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 LOA1YPR139C 903 nt0.39□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 CHS6YJL099W 2241 nt0.38□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YHL042WYHL042W 453 nt0.38□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 EFR3YMR212C 2349 nt0.38□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 NPR2YEL062W 1848 nt0.38□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 AI1Q0050 2505 nt0.37□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YFL012WYFL012W 447 nt0.36□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.36□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 UBC7YMR022W 498 nt0.36□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.36□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 NOP9YJL010C 2001 nt0.35□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YDR344CYDR344C 444 nt0.35□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.35□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YJL135WYJL135W 318 nt0.35□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 ISF1YMR081C 1017 nt0.35□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 PKH2YOL100W 3246 nt0.35□□□□□ -2.35
ABP140Q08641 YDR029WYDR029W 315 nt0.34□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.34□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 TSC3YBR058C-A 243 nt0.34□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 snR72snR72 98 nt0.33□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 NFU1YKL040C 771 nt0.33□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 RPS27AYKL156W 249 nt0.33□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 RPL26AYLR344W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.32□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.32□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 YGR290WYGR290W 444 nt0.32□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 RPS24BYIL069C 408 nt0.32□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.32□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.31□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 RPL26BYGR034W 384 nt0.31□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 RPF1YHR088W 888 nt0.31□□□□□ -2.36
ABP140Q08641 BIG1YHR101C 1008 nt0.31□□□□□ -2.36
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