Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 MLP2YIL149C 5040 nt0.08□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 RSM27YGR215W 333 nt0.07□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 TIM10YHR005C-A 282 nt0.07□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 MRPL31YKL138C 396 nt0.07□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YOR282WYOR282W 321 nt0.07□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 NPC2YDL046W 522 nt0.06□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 SPO11YHL022C 1197 nt0.06□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YLR252WYLR252W 306 nt0.06□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 RSM23YGL129C 1353 nt0.06□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 RPL9AYGL147C 576 nt0.05□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.05□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 LOA1YPR139C 903 nt0.05□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 AFR1YDR085C 1863 nt0.05□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 CWC23YGL128C 852 nt0.04□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YLR217WYLR217W 324 nt0.04□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 BI4Q0120 1917 nt0.04□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.03□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.03□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 YLR271WYLR271W 825 nt0.03□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 snR13snR13 124 nt0.03□□□□□ -2.4
LDB18Q07887 PET111YMR257C 2403 nt0.03□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 BSC3YLR465C 309 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 CDC33YOL139C 642 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 VAM3YOR106W 852 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YPR096CYPR096C 303 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 BUL2YML111W 2763 nt0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 BIG1YHR101C 1008 nt0.01□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.01□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 RFX1YLR176C 2436 nt0.01□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 snR5snR5 204 nt0□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YER138W-AYER138W-A 105 nt0□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 GPG1YGL121C 381 nt0□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 VMA21YGR105W 234 nt0□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YHL042WYHL042W 453 nt0□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YJR079WYJR079W 330 nt0□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 RCN2YOR220W 798 nt-0.01□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 FYV10YIL097W 1551 nt-0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 SDS22YKL193C 1017 nt-0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 COX12YLR038C 252 nt-0.02□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 ESP1YGR098C 4893 nt-0.03□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 MLP1YKR095W 5628 nt-0.03□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 YGL015CYGL015C 393 nt-0.03□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.03□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 CSM4YPL200W 471 nt-0.03□□□□□ -2.41
LDB18Q07887 PRP5YBR237W 2550 nt-0.04□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 VIK1YPL253C 1944 nt-0.04□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-0.04□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 PKH2YOL100W 3246 nt-0.04□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 BUD26YDR241W 288 nt-0.05□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YOR053WYOR053W 342 nt-0.05□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 snR45snR45 172 nt-0.05□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 MCM10YIL150C 1716 nt-0.05□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YGR228WYGR228W 345 nt-0.06□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-0.06□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 IRC16YPR038W 360 nt-0.06□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YCL002CYCL002C 792 nt-0.06□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 RPL26AYLR344W 384 nt-0.07□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.07□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YPL044CYPL044C 549 nt-0.07□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YBR064WYBR064W 429 nt-0.07□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 INP2YMR163C 2118 nt-0.07□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 ORC3YLL004W 1851 nt-0.07□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YDR269CYDR269C 324 nt-0.08□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YJL135WYJL135W 318 nt-0.08□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YLR232WYLR232W 348 nt-0.09□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt-0.09□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 snR190snR190 190 nt-0.09□□□□□ -2.42
LDB18Q07887 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.1□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YLR198CYLR198C 360 nt-0.1□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YMR254CYMR254C 309 nt-0.1□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 SEC8YPR055W 3198 nt-0.1□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 SVS1YPL163C 783 nt-0.11□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 RCO1YMR075W 2055 nt-0.12□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 PRP42YDR235W 1635 nt-0.12□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YNL050CYNL050C 813 nt-0.12□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 LEE1YPL054W 906 nt-0.12□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 CUL3YGR003W 2235 nt-0.12□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 ASE1YOR058C 2658 nt-0.13□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 SSS1YDR086C 243 nt-0.13□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 OLI1Q0130 231 nt-0.13□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YGR115CYGR115C 780 nt-0.13□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YOR248WYOR248W 303 nt-0.13□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 MRPL32YCR003W 552 nt-0.14□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YER135CYER135C 393 nt-0.14□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.14□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YPR039WYPR039W 336 nt-0.14□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 POP7YBR167C 423 nt-0.14□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 COG8YML071C 1824 nt-0.15□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.15□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.15□□□□□ -2.43
LDB18Q07887 snR72snR72 98 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 snR9snR9 187 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 PRP21YJL203W 843 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 ILM1YJR118C 612 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 MRPL50YNR022C 420 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 RPB10YOR210W 213 nt-0.16□□□□□ -2.44
LDB18Q07887 OST4YDL232W 111 nt-0.17□□□□□ -2.44
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