Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 AXL1YPR122W 3627 nt2.61□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 ZIP1YDR285W 2628 nt2.61□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 PUT3YKL015W 2940 nt2.61□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.6□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 LYS14YDR034C 2373 nt2.6□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 snR81snR81 201 nt2.6□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.6□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.6□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 KRE33YNL132W 3171 nt2.59□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 CHS6YJL099W 2241 nt2.59□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.59□□□□□ -1.99
BRE4Q07660 RIC1YLR039C 3171 nt2.58□□□□□ -2
BRE4Q07660 ESC1YMR219W 4977 nt2.57□□□□□ -2
BRE4Q07660 STB4YMR019W 2850 nt2.57□□□□□ -2
BRE4Q07660 SCH9YHR205W 2475 nt2.57□□□□□ -2
BRE4Q07660 NUP100YKL068W 2880 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 SEC63YOR254C 1992 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 SLD3YGL113W 2007 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 TRS130YMR218C 3309 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 COX12YLR038C 252 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 PRP5YBR237W 2550 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 RGA2YDR379W 3030 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 YOR296WYOR296W 3870 nt2.56□□□□□ -2
BRE4Q07660 SBE22YHR103W 2559 nt2.55□□□□□ -2
BRE4Q07660 NUM1YDR150W 8247 nt2.55□□□□□ -2
BRE4Q07660 RRP6YOR001W 2202 nt2.55□□□□□ -2
BRE4Q07660 YPL216WYPL216W 3309 nt2.55□□□□□ -2
BRE4Q07660 POL3YDL102W 3294 nt2.55□□□□□ -2
BRE4Q07660 ZIP2YGL249W 2115 nt2.54□□□□□ -2
BRE4Q07660 TAE2YPL009C 3117 nt2.54□□□□□ -2
BRE4Q07660 RAD34YDR314C 2079 nt2.54□□□□□ -2
BRE4Q07660 YFR016CYFR016C 3702 nt2.54□□□□□ -2
BRE4Q07660 MNL2YLR057W 2550 nt2.54□□□□□ -2
BRE4Q07660 SLX4YLR135W 2247 nt2.53□□□□□ -2
BRE4Q07660 IRR1YIL026C 3453 nt2.53□□□□□ -2
BRE4Q07660 YME2YMR302C 2553 nt2.53□□□□□ -2
BRE4Q07660 SPO22YIL073C 2928 nt2.53□□□□□ -2
BRE4Q07660 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
BRE4Q07660 SET2YJL168C 2202 nt2.53□□□□□ -2
BRE4Q07660 PAU8YAL068C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 PAU18YLL064C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 PAU6YNR076W 363 nt2.52□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 PAU20YOL161C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YLL054CYLL054C 2532 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 CAT2YML042W 2013 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 PHO91YNR013C 2685 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 KAP123YER110C 3342 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 NAM7YMR080C 2916 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 VMR1YHL035C 4779 nt2.51□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 STE11YLR362W 2154 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 HSH155YMR288W 2916 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YER138CYER138C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YER160CYER160C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YJR027WYJR027W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YML039WYML039W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YML045WYML045W 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YMR050CYMR050C 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 MLH1YMR167W 2310 nt2.5□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 SWR1YDR334W 4545 nt2.49□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 BCK1YJL095W 4437 nt2.49□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 AFI1YOR129C 2682 nt2.48□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 TIM9YEL020W-A 264 nt2.48□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 QCR9YGR183C 201 nt2.48□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 CRM1YGR218W 3255 nt2.48□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 IRC8YJL051W 2469 nt2.48□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 SLM1YIL105C 2061 nt2.48□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 UBP15YMR304W 3693 nt2.47□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt2.47□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.47□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 SNC1YAL030W 354 nt2.47□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 CYR1YJL005W 6081 nt2.47□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 YEF3YLR249W 3135 nt2.46□□□□□ -2.01
BRE4Q07660 MAD1YGL086W 2250 nt2.46□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 SKP2YNL311C 2292 nt2.46□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YGL182CYGL182C 324 nt2.46□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt2.46□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.46□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.45□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 snR39BsnR39B 96 nt2.45□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 SET3YKR029C 2256 nt2.45□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 IFH1YLR223C 3258 nt2.44□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 ATG11YPR049C 3537 nt2.44□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 STB6YKL072W 2301 nt2.44□□□□□ -2.02
BRE4Q07660 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms