Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 SLI15YBR156C 2097 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 ISD11YER048W-A 285 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 ECM12YHR021W-A 456 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 UBX4YMR067C 1251 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 RCN2YOR220W 798 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 SNU56YDR240C 1479 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 PAC1YOR269W 1485 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 NPC2YDL046W 522 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YFL012WYFL012W 447 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 PRE4YFR050C 801 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YAR009CYAR009C 3591 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 PAN2YGL094C 3348 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YGR025WYGR025W 303 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 APQ13YJL075C 417 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 BER1YLR412W 825 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 snR13snR13 124 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 COG4YPR105C 2586 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 PHS1YJL097W 654 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YJR003CYJR003C 1560 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR226CQ05016 YSP1YHR155W 3687 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YGL239CYGL239C 315 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YHL042WYHL042W 453 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 SVS1YPL163C 783 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 snR78snR78 87 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YDR269CYDR269C 324 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 LOA1YPR139C 903 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 ILM1YJR118C 612 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YLL007CYLL007C 1998 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 PMP1YCR024C-A 123 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YDR029WYDR029W 315 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 NFU1YKL040C 771 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 GEA2YEL022W 4380 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 CHS6YJL099W 2241 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 RPL9AYGL147C 576 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 URM1YIL008W 300 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 INA22YIR024C 651 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 YOR282WYOR282W 321 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 NOP9YJL010C 2001 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 ZIP2YGL249W 2115 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 MYO1YHR023W 5787 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 WIP1YDR374W-A 270 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 OST1YJL002C 1431 nt0.4□□□□□ -2.34
YMR226CQ05016 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 GPG1YGL121C 381 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YJL135WYJL135W 318 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YNL319WYNL319W 441 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 TSC3YBR058C-A 243 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 NPR2YEL062W 1848 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YKL123WYKL123W 381 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YLR269CYLR269C 351 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 ABF2YMR072W 552 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YOR218CYOR218C 420 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YCR001WYCR001W 315 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 snR72snR72 98 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 RPF1YHR088W 888 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 BIG1YHR101C 1008 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 GPI15YNL038W 690 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.35□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 FMP27YLR454W 7887 nt0.34□□□□□ -2.35
YMR226CQ05016 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 UBC7YMR022W 498 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YOL160WYOL160W 342 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YBR064WYBR064W 429 nt0.34□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YMR160WYMR160W 2451 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 EFR3YMR212C 2349 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 ASE1YOR058C 2658 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YCK3YER123W 1575 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 CDC33YOL139C 642 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YPL182CYPL182C 384 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 RAD34YDR314C 2079 nt0.33□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YDR344CYDR344C 444 nt0.32□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 PKH2YOL100W 3246 nt0.32□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 EMC4YGL231C 573 nt0.31□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 TIM13YGR181W 318 nt0.31□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 MCM10YIL150C 1716 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 RPS24BYIL069C 408 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 STE18YJR086W 333 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YKL202WYKL202W 582 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YPL261CYPL261C 309 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 YBR206WYBR206W 324 nt0.3□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 RPL26BYGR034W 384 nt0.29□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 RPL26AYLR344W 384 nt0.29□□□□□ -2.36
YMR226CQ05016 RPB10YOR210W 213 nt0.29□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94.8 ms