Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 SEC63YOR254C 1992 nt1.63□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 TFC8YPL007C 1767 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 HTL1YCR020W-B 237 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 RPL31AYDL075W 342 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YOP1YPR028W 543 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 CAT8YMR280C 4302 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 EFR3YMR212C 2349 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 LYS14YDR034C 2373 nt1.62□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 PMD1YER132C 5262 nt1.61□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 MON2YNL297C 4911 nt1.61□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 NPC2YDL046W 522 nt1.61□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.61□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.61□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 ALG13YGL047W 609 nt1.6□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 SPO24YPR036W-A 204 nt1.6□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 MDS3YGL197W 4464 nt1.6□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 RIM20YOR275C 1986 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 RFX1YLR176C 2436 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 BRR2YER172C 6492 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 MSC6YOR354C 2079 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YGL149WYGL149W 306 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YGR069WYGR069W 336 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YIL102CYIL102C 306 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 PIP2YOR363C 2991 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.59□□□□□ -2.15
RRN11Q04712 ZRG17YNR039C 1818 nt1.59□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 MPT5YGL178W 2580 nt1.58□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 ZRG8YER033C 3231 nt1.58□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 MSH6YDR097C 3729 nt1.58□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 SSS1YDR086C 243 nt1.58□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YIL032CYIL032C 357 nt1.58□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 PAU3YCR104W 375 nt1.57□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.57□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 TRX1YLR043C 312 nt1.57□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt1.57□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 SEY1YOR165W 2331 nt1.57□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 RAD61YDR014W 1944 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 snR60snR60 104 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 snR8snR8 190 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 INA22YIR024C 651 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 PCC1YKR095W-A 267 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 RPB10YOR210W 213 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YPR063CYPR063C 423 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YLL032CYLL032C 2478 nt1.56□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 CTF4YPR135W 2784 nt1.55□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 HKR1YDR420W 5409 nt1.55□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 MSH5YDL154W 2706 nt1.55□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 INP2YMR163C 2118 nt1.55□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 MUK1YPL070W 1839 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 snR80snR80 171 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 COA6YMR244C-A 315 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 ENV11YGR071C 2583 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 SWI6YLR182W 2412 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 FYV8YGR196C 2454 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 SPC98YNL126W 2541 nt1.54□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YOR015WYOR015W 360 nt1.53□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 SKI3YPR189W 4299 nt1.53□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 LAA1YJL207C 6045 nt1.53□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 SSK2YNR031C 4740 nt1.53□□□□□ -2.16
RRN11Q04712 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.52□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YGL041CYGL041C 204 nt1.52□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YGR265WYGR265W 411 nt1.52□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 SXM1YDR395W 2835 nt1.52□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 PET127YOR017W 2403 nt1.51□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YGR250CYGR250C 2346 nt1.51□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 HMRA2YCR096C 360 nt1.51□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YJL015CYJL015C 285 nt1.51□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 HMI1YOL095C 2121 nt1.51□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 NIP100YPL174C 2607 nt1.51□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 RLM1YPL089C 2031 nt1.5□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 SCW11YGL028C 1629 nt1.49□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 SDH2YLL041C 801 nt1.49□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 ZIP1YDR285W 2628 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 COG8YML071C 1824 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YHL042WYHL042W 453 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 CDC31YOR257W 486 nt1.48□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 YBR064WYBR064W 429 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 OST1YJL002C 1431 nt1.47□□□□□ -2.17
RRN11Q04712 SPT21YMR179W 2277 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 PAU2YEL049W 363 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 YOL160WYOL160W 342 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 SEC21YNL287W 2808 nt1.46□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 SLY1YDR189W 2001 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 SPO75YLL005C 2607 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 BST1YFL025C 3090 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 KAP122YGL016W 3246 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 VIK1YPL253C 1944 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 YDL211CYDL211C 1119 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 YLR140WYLR140W 327 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 APL2YKL135C 2181 nt1.45□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 LCD1YDR499W 2244 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 PIG1YLR273C 1947 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 YCK3YER123W 1575 nt1.44□□□□□ -2.18
RRN11Q04712 NPR2YEL062W 1848 nt1.44□□□□□ -2.18
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