Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme1P97371 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Psme1P97371 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Psme1P97371 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Psme1P97371 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Psme1P97371 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms