Protein–RNA interactions for Protein: P43535

GCN20, Protein GCN20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN20P43535 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.55□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YLL007CYLL007C 1998 nt0.55□□□□□ -2.32
GCN20P43535 COG4YPR105C 2586 nt0.54□□□□□ -2.32
GCN20P43535 PAC1YOR269W 1485 nt0.54□□□□□ -2.32
GCN20P43535 INA22YIR024C 651 nt0.54□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.54□□□□□ -2.32
GCN20P43535 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.53□□□□□ -2.32
GCN20P43535 VMA21YGR105W 234 nt0.53□□□□□ -2.32
GCN20P43535 HUG1YML058W-A 207 nt0.53□□□□□ -2.32
GCN20P43535 RCN2YOR220W 798 nt0.53□□□□□ -2.32
GCN20P43535 OST1YJL002C 1431 nt0.53□□□□□ -2.32
GCN20P43535 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.33
GCN20P43535 LTE1YAL024C 4308 nt0.52□□□□□ -2.33
GCN20P43535 RPS30BYOR182C 192 nt0.52□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YJR003CYJR003C 1560 nt0.52□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YDR269CYDR269C 324 nt0.51□□□□□ -2.33
GCN20P43535 APQ13YJL075C 417 nt0.51□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.51□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YMR160WYMR160W 2451 nt0.51□□□□□ -2.33
GCN20P43535 PAN2YGL094C 3348 nt0.5□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.5□□□□□ -2.33
GCN20P43535 URM1YIL008W 300 nt0.5□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.5□□□□□ -2.33
GCN20P43535 ZIP2YGL249W 2115 nt0.5□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.49□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YGL239CYGL239C 315 nt0.49□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YKL044WYKL044W 321 nt0.49□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YSP1YHR155W 3687 nt0.48□□□□□ -2.33
GCN20P43535 RPL9AYGL147C 576 nt0.48□□□□□ -2.33
GCN20P43535 GPG1YGL121C 381 nt0.47□□□□□ -2.33
GCN20P43535 HUR1YGL168W 333 nt0.47□□□□□ -2.33
GCN20P43535 PHS1YJL097W 654 nt0.47□□□□□ -2.33
GCN20P43535 YOR282WYOR282W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
GCN20P43535 MYO1YHR023W 5787 nt0.46□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YER135CYER135C 393 nt0.46□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YHL042WYHL042W 453 nt0.46□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.45□□□□□ -2.34
GCN20P43535 LOA1YPR139C 903 nt0.45□□□□□ -2.34
GCN20P43535 Q0255Q0255 1419 nt0.45□□□□□ -2.34
GCN20P43535 EFR3YMR212C 2349 nt0.44□□□□□ -2.34
GCN20P43535 BER1YLR412W 825 nt0.44□□□□□ -2.34
GCN20P43535 CHS6YJL099W 2241 nt0.44□□□□□ -2.34
GCN20P43535 PMP1YCR024C-A 123 nt0.43□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YGR025WYGR025W 303 nt0.43□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.43□□□□□ -2.34
GCN20P43535 NPR2YEL062W 1848 nt0.43□□□□□ -2.34
GCN20P43535 snR13snR13 124 nt0.42□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YOR218CYOR218C 420 nt0.42□□□□□ -2.34
GCN20P43535 SVS1YPL163C 783 nt0.42□□□□□ -2.34
GCN20P43535 PKH2YOL100W 3246 nt0.42□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YJL135WYJL135W 318 nt0.41□□□□□ -2.34
GCN20P43535 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.4□□□□□ -2.35
GCN20P43535 NOP9YJL010C 2001 nt0.4□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YDR344CYDR344C 444 nt0.39□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YJR141WYJR141W 1044 nt0.39□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 RPS27AYKL156W 249 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 UTP20YBL004W 7482 nt0.38□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YDR029WYDR029W 315 nt0.37□□□□□ -2.35
GCN20P43535 RPS24BYIL069C 408 nt0.37□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.37□□□□□ -2.35
GCN20P43535 CDC33YOL139C 642 nt0.37□□□□□ -2.35
GCN20P43535 RPB10YOR210W 213 nt0.37□□□□□ -2.35
GCN20P43535 RPL26BYGR034W 384 nt0.36□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.36□□□□□ -2.35
GCN20P43535 TSC3YBR058C-A 243 nt0.36□□□□□ -2.35
GCN20P43535 YDL016CYDL016C 303 nt0.35□□□□□ -2.35
GCN20P43535 UBX4YMR067C 1251 nt0.35□□□□□ -2.35
GCN20P43535 SNU56YDR240C 1479 nt0.35□□□□□ -2.35
GCN20P43535 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.34□□□□□ -2.36
GCN20P43535 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.34□□□□□ -2.36
GCN20P43535 ABF2YMR072W 552 nt0.34□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.33□□□□□ -2.36
GCN20P43535 RPL26AYLR344W 384 nt0.33□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YPL182CYPL182C 384 nt0.33□□□□□ -2.36
GCN20P43535 SBH1YER087C-B 249 nt0.32□□□□□ -2.36
GCN20P43535 UBC7YMR022W 498 nt0.32□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YOL160WYOL160W 342 nt0.32□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YPL261CYPL261C 309 nt0.32□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YCK3YER123W 1575 nt0.32□□□□□ -2.36
GCN20P43535 FMP27YLR454W 7887 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 ULP2YIL031W 3105 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 BIG1YHR101C 1008 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YKL202WYKL202W 582 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YPL044CYPL044C 549 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 ESP1YGR098C 4893 nt0.31□□□□□ -2.36
GCN20P43535 snR72snR72 98 nt0.3□□□□□ -2.36
GCN20P43535 BSC3YLR465C 309 nt0.3□□□□□ -2.36
GCN20P43535 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.29□□□□□ -2.36
GCN20P43535 RAD34YDR314C 2079 nt0.29□□□□□ -2.36
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