Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 NUP157YER105C 4176 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YDL158CYDL158C 309 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 RRT1YBL048W 312 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YPL182CYPL182C 384 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 IML1YJR138W 4755 nt0.69□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YPR117WYPR117W 7470 nt0.68□□□□□ -2.3
PGD1P40356 WIP1YDR374W-A 270 nt0.68□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YOR199WYOR199W 330 nt0.68□□□□□ -2.3
PGD1P40356 PDE2YOR360C 1581 nt0.67□□□□□ -2.3
PGD1P40356 NPC2YDL046W 522 nt0.67□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.67□□□□□ -2.3
PGD1P40356 EFR3YMR212C 2349 nt0.66□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YDL206WYDL206W 2289 nt0.66□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.66□□□□□ -2.3
PGD1P40356 MMS4YBR098W 2076 nt0.66□□□□□ -2.3
PGD1P40356 SLI15YBR156C 2097 nt0.66□□□□□ -2.3
PGD1P40356 YDL196WYDL196W 330 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YGR042WYGR042W 816 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 TIM13YGR181W 318 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YGR290WYGR290W 444 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YHR125WYHR125W 306 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YBL071CYBL071C 309 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 ZEO1YOL109W 342 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 ZIP2YGL249W 2115 nt0.65□□□□□ -2.31
PGD1P40356 RPS27AYKL156W 249 nt0.64□□□□□ -2.31
PGD1P40356 FYV7YLR068W 456 nt0.64□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YJR003CYJR003C 1560 nt0.64□□□□□ -2.31
PGD1P40356 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
PGD1P40356 COG4YPR105C 2586 nt0.63□□□□□ -2.31
PGD1P40356 BI2Q0110 1272 nt0.63□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YHR130CYHR130C 336 nt0.63□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YNL122CYNL122C 348 nt0.63□□□□□ -2.31
PGD1P40356 RKR1YMR247C 4689 nt0.63□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YDL011CYDL011C 324 nt0.62□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YJL135WYJL135W 318 nt0.62□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.62□□□□□ -2.31
PGD1P40356 RIM20YOR275C 1986 nt0.62□□□□□ -2.31
PGD1P40356 WAR1YML076C 2835 nt0.62□□□□□ -2.31
PGD1P40356 SWF1YDR126W 1011 nt0.61□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.61□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YKL202WYKL202W 582 nt0.61□□□□□ -2.31
PGD1P40356 RPB10YOR210W 213 nt0.61□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YAR009CYAR009C 3591 nt0.61□□□□□ -2.31
PGD1P40356 snR72snR72 98 nt0.6□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.6□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.6□□□□□ -2.31
PGD1P40356 NHP2YDL208W 471 nt0.59□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YLR287CYLR287C 1068 nt0.59□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YOL160WYOL160W 342 nt0.59□□□□□ -2.31
PGD1P40356 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.59□□□□□ -2.31
PGD1P40356 snR54snR54 86 nt0.59□□□□□ -2.31
PGD1P40356 GEA2YEL022W 4380 nt0.59□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YLR171WYLR171W 390 nt0.58□□□□□ -2.32
PGD1P40356 LOA1YPR139C 903 nt0.58□□□□□ -2.32
PGD1P40356 GPG1YGL121C 381 nt0.57□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt0.57□□□□□ -2.32
PGD1P40356 UBC7YMR022W 498 nt0.57□□□□□ -2.32
PGD1P40356 TOM22YNL131W 459 nt0.57□□□□□ -2.32
PGD1P40356 snR51snR51 107 nt0.57□□□□□ -2.32
PGD1P40356 DIE2YGR227W 1578 nt0.57□□□□□ -2.32
PGD1P40356 PAN2YGL094C 3348 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 PKH2YOL100W 3246 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 CBS1YDL069C 690 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YHL041WYHL041W 450 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YHL042WYHL042W 453 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 IES4YOR189W 351 nt0.56□□□□□ -2.32
PGD1P40356 PAC1YOR269W 1485 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 RAD34YDR314C 2079 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 SDH7YDR511W 402 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YDR521WYDR521W 336 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 ALG13YGL047W 609 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 ECL1YGR146C 636 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YPL261CYPL261C 309 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 snR189snR189 189 nt0.55□□□□□ -2.32
PGD1P40356 DBP6YNR038W 1890 nt0.54□□□□□ -2.32
PGD1P40356 BFR2YDR299W 1605 nt0.54□□□□□ -2.32
PGD1P40356 PAM16YJL104W 450 nt0.54□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YLR101CYLR101C 396 nt0.54□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt0.54□□□□□ -2.32
PGD1P40356 snR41snR41 95 nt0.54□□□□□ -2.32
PGD1P40356 CMC4YMR194C-B 222 nt0.53□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YPL229WYPL229W 621 nt0.53□□□□□ -2.32
PGD1P40356 YML002WYML002W 2214 nt0.52□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YAP6YDR259C 1152 nt0.52□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.52□□□□□ -2.33
PGD1P40356 ISD11YER048W-A 285 nt0.52□□□□□ -2.33
PGD1P40356 RPL26AYLR344W 384 nt0.52□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YNL303WYNL303W 348 nt0.52□□□□□ -2.33
PGD1P40356 YKL083WYKL083W 615 nt0.51□□□□□ -2.33
PGD1P40356 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
PGD1P40356 INP2YMR163C 2118 nt0.5□□□□□ -2.33
PGD1P40356 UBP3YER151C 2739 nt0.5□□□□□ -2.33
PGD1P40356 STF2YGR008C 255 nt0.5□□□□□ -2.33
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