Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 RFX1YLR176C 2436 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 SPO13YHR014W 876 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 PHS1YJL097W 654 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YJR003CYJR003C 1560 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YPT6YLR262C 648 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 CDC33YOL139C 642 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 IRC16YPR038W 360 nt0.17□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 NOP9YJL010C 2001 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 ULP2YIL031W 3105 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YCK3YER123W 1575 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 FMP27YLR454W 7887 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 PMP1YCR024C-A 123 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 SPO11YHL022C 1197 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.16□□□□□ -2.38
YHR140WP38842 MLP2YIL149C 5040 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YER135CYER135C 393 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 RPL9AYGL147C 576 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 PAU12YGR294W 363 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YJR087WYJR087W 351 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 RPL26AYLR344W 384 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 UBX4YMR067C 1251 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 AFR1YDR085C 1863 nt0.15□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 ZIP2YGL249W 2115 nt0.14□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YDL187CYDL187C 330 nt0.14□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YPR039WYPR039W 336 nt0.14□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 PKH2YOL100W 3246 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YDR269CYDR269C 324 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 GPG1YGL121C 381 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 SLX9YGR081C 633 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YHL042WYHL042W 453 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YLR252WYLR252W 306 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YNL050CYNL050C 813 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 LOA1YPR139C 903 nt0.13□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 ILM1YJR118C 612 nt0.12□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 ECM9YKR004C 1134 nt0.12□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 BSC3YLR465C 309 nt0.12□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 RPS30BYOR182C 192 nt0.12□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 MLP1YKR095W 5628 nt0.12□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YAL066WYAL066W 309 nt0.11□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 AFB1YLR040C 675 nt0.11□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 MCM10YIL150C 1716 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 MPC1YGL080W 393 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 HUR1YGL168W 333 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YJL135WYJL135W 318 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 UBC7YMR022W 498 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 RPB10YOR210W 213 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 YBR064WYBR064W 429 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 TRS65YGR166W 1683 nt0.1□□□□□ -2.39
YHR140WP38842 snR72snR72 98 nt0.09□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 BIG1YHR101C 1008 nt0.09□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.09□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YOR248WYOR248W 303 nt0.09□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 PET111YMR257C 2403 nt0.09□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.08□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 RCN2YOR220W 798 nt0.08□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 IQG1YPL242C 4488 nt0.08□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.08□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 UTP20YBL004W 7482 nt0.08□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 SEC8YPR055W 3198 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 EMC4YGL231C 573 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YGL239CYGL239C 315 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YLR198CYLR198C 360 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YOL029CYOL029C 606 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 EFR3YMR212C 2349 nt0.07□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 AI1Q0050 2505 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YGR025WYGR025W 303 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YGR290WYGR290W 444 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YIL029CYIL029C 429 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YPL044CYPL044C 549 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 GRX5YPL059W 453 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 FYV10YIL097W 1551 nt0.06□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 INP2YMR163C 2118 nt0.05□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 VMA21YGR105W 234 nt0.05□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YJR141WYJR141W 1044 nt0.05□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YDR029WYDR029W 315 nt0.04□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 OLI1Q0130 231 nt0.04□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.04□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YKL044WYKL044W 321 nt0.04□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.04□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 ASE1YOR058C 2658 nt0.03□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.03□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.03□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 PRP21YJL203W 843 nt0.03□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 snR13snR13 124 nt0.03□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.03□□□□□ -2.4
YHR140WP38842 ORC3YLL004W 1851 nt0.03□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 APQ13YJL075C 417 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 COX12YLR038C 252 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YMR321CYMR321C 318 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 IPP1YBR011C 864 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 VIK1YPL253C 1944 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 PRP5YBR237W 2550 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 RAD34YDR314C 2079 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 SNU56YDR240C 1479 nt0.02□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 STF2YGR008C 255 nt0.01□□□□□ -2.41
YHR140WP38842 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.3 ms