Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rfx7F8VPJ6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rfx7F8VPJ6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms