Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Knop1Q9Z2Q2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms