Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph3bQ9DA80 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rsph3bQ9DA80 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rsph3bQ9DA80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rsph3bQ9DA80 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rsph3bQ9DA80 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rsph3bQ9DA80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph3bQ9DA80 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1008.3 ms